More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2280 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  45.84 
 
 		 812 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 742 aa  1510    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  43.39 
 
 		 809 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 786 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 850 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 		 815 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  30.48 
 
 		 792 aa  278  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 825 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 825 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 843 aa  243  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 817 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 862 aa  234  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 864 aa  234  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 860 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 712 aa  228  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 709 aa  226  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.22 
 
 		 703 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 708 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.79 
 
 		 708 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.49 
 
 		 709 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 694 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.9 
 
 		 696 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 703 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 706 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 706 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 715 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 696 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 859 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 789 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 707 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 837 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  27.83 
 
 		 689 aa  209  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.33 
 
 		 703 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 710 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 770 aa  208  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 711 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 708 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.86 
 
 		 695 aa  205  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 741 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 707 aa  204  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 778 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 701 aa  204  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 722 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 709 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 757 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 710 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 809 aa  200  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 767 aa  200  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 734 aa  198  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 730 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 689 aa  196  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  23.31 
 
 		 726 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  23.45 
 
 		 726 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 724 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 807 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 701 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 702 aa  194  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 702 aa  194  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 720 aa  194  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 710 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 743 aa  193  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 723 aa  193  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  25.57 
 
 		 703 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 692 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 701 aa  191  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 710 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 715 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 701 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 724 aa  190  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 701 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 710 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 701 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 689 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 805 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 743 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  24.27 
 
 		 700 aa  188  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  26.49 
 
 		 699 aa  188  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 786 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 701 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.12 
 
 		 711 aa  187  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 720 aa  187  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 701 aa  187  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 719 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 732 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 720 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 720 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 745 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 829 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 736 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  25.25 
 
 		 680 aa  184  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 732 aa  184  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 714 aa  184  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 722 aa  184  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 799 aa  183  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 907 aa  183  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 795 aa  183  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 732 aa  183  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 720 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 715 aa  183  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 722 aa  183  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>