More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3559 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3559  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 707 aa  1436    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.740421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2554  TonB-dependent siderophore receptor  41.69 
 
 		 776 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.97 
 
 		 728 aa  329  8e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 843 aa  247  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 		 862 aa  245  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 850 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 710 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 864 aa  218  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 707 aa  217  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 708 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 713 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.36 
 
 		 711 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 859 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 837 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 741 aa  211  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 719 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 708 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.29 
 
 		 696 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 696 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 817 aa  207  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 715 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  27.11 
 
 		 716 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 820 aa  203  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.77 
 
 		 709 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 711 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 709 aa  200  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 794 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 829 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 692 aa  200  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 710 aa  200  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  29.24 
 
 		 716 aa  200  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.87 
 
 		 703 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 706 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 706 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 727 aa  198  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 778 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  28.22 
 
 		 708 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 701 aa  197  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  27.54 
 
 		 715 aa  196  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 825 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  29.07 
 
 		 695 aa  196  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 726 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 712 aa  195  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 825 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 722 aa  194  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 828 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 726 aa  193  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 828 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 733 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 828 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  27.62 
 
 		 711 aa  190  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 723 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 701 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 712 aa  189  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 771 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 710 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 730 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 724 aa  187  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 797 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 709 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 757 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 779 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 694 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  27.31 
 
 		 691 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  27.3 
 
 		 703 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 734 aa  183  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  27.3 
 
 		 703 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 821 aa  182  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 860 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  27.3 
 
 		 729 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 721 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 817 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  27.22 
 
 		 719 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 829 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.3 
 
 		 806 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 724 aa  181  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  26.03 
 
 		 752 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  26.28 
 
 		 729 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 755 aa  180  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  26.28 
 
 		 729 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 736 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 715 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 724 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 696 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.95 
 
 		 797 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  27.64 
 
 		 696 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  27.64 
 
 		 698 aa  177  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 743 aa  176  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  27.64 
 
 		 696 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 727 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 723 aa  176  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 815 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 802 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.37 
 
 		 833 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 726 aa  175  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  25.71 
 
 		 747 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  25.11 
 
 		 747 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  27.64 
 
 		 696 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 793 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 738 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>