More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3412 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  100 
 
 		 691 aa  1405    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 713 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 701 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 733 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 713 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 767 aa  257  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 821 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 797 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 730 aa  250  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 837 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 723 aa  247  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 719 aa  244  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 699 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  28.71 
 
 		 808 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 733 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 745 aa  240  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 808 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  29.9 
 
 		 799 aa  237  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 810 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 810 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  29.87 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 717 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 778 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 701 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 806 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  28.67 
 
 		 711 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  28.2 
 
 		 716 aa  233  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 794 aa  233  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 820 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.58 
 
 		 806 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 717 aa  232  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 705 aa  232  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 797 aa  230  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  28.4 
 
 		 696 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 736 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  28.84 
 
 		 733 aa  227  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 812 aa  227  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.04 
 
 		 708 aa  227  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.37 
 
 		 797 aa  227  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  28.4 
 
 		 696 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  28.25 
 
 		 696 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  28.4 
 
 		 698 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 721 aa  226  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  28.25 
 
 		 696 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 726 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.97 
 
 		 703 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.89 
 
 		 801 aa  223  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 810 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 696 aa  223  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  27.72 
 
 		 745 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 735 aa  223  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  28.64 
 
 		 729 aa  222  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 794 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 706 aa  220  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 810 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 799 aa  220  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 828 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 829 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  27.78 
 
 		 747 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  27.42 
 
 		 729 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 828 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 819 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  27.78 
 
 		 747 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 709 aa  218  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 828 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  28.06 
 
 		 740 aa  217  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 825 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.85 
 
 		 833 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 779 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 817 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  27.65 
 
 		 747 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 825 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  27.34 
 
 		 747 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  27.49 
 
 		 747 aa  214  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  27.44 
 
 		 729 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 710 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  28.13 
 
 		 703 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  28.13 
 
 		 703 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  27.69 
 
 		 715 aa  213  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 815 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 701 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 717 aa  212  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  29.08 
 
 		 740 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  27.69 
 
 		 752 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  27.18 
 
 		 729 aa  211  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 802 aa  211  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  27.44 
 
 		 747 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 740 aa  211  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 831 aa  210  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 696 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 799 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 745 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 776 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 747 aa  208  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  27.78 
 
 		 747 aa  208  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 744 aa  207  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 828 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  28.24 
 
 		 728 aa  206  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 769 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 744 aa  205  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>