More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00024 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00024  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 163 aa  329  8e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0168751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  58.49 
 
 		 728 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2554  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 		 776 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 850 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 785 aa  81.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 790 aa  80.9  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  34.38 
 
 		 837 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  32.28 
 
 		 782 aa  78.2  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  35.42 
 
 		 864 aa  77.8  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 		 859 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 862 aa  75.1  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 824 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 789 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 860 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 689 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 806 aa  70.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 		 723 aa  70.9  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 819 aa  70.5  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 724 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 817 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 713 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 821 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0726  ferric siderophore receptor  31.72 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  34.19 
 
 		 716 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 843 aa  67.4  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 767 aa  67.4  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.33 
 
 		 801 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 734 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 769 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 771 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.83 
 
 		 703 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 771 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 726 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 769 aa  64.3  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  28.66 
 
 		 708 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 814 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3559  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 707 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.740421 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 877 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 718 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 715 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 743 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 797 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 726 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.13 
 
 		 689 aa  61.6  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 709 aa  61.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 786 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 711 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 741 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 752 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 736 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 736 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 717 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 707 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 700 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 737 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 708 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  29.41 
 
 		 752 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 738 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  31.78 
 
 		 753 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  31.78 
 
 		 753 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 810 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 736 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 784 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 730 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 907 aa  58.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 696 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 701 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  26.58 
 
 		 729 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 810 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 806 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  30.15 
 
 		 729 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 815 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 809 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.09 
 
 		 696 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.26 
 
 		 703 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 703 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 793 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 		 809 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 829 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  27.94 
 
 		 747 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 747 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  27.94 
 
 		 747 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.49 
 
 		 709 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  27.94 
 
 		 747 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 787 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  27.94 
 
 		 745 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 707 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 785 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  27.94 
 
 		 747 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 820 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 799 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 701 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 762 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 701 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 785 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 701 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 761 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 794 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 696 aa  54.3  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 753 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>