More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07040 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  100 
 
 		 808 aa  1628    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  44.17 
 
 		 806 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  42.41 
 
 		 816 aa  649    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  47.96 
 
 		 809 aa  742    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  45.71 
 
 		 810 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  43.1 
 
 		 810 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  41.91 
 
 		 907 aa  622  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  39.85 
 
 		 795 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  39.34 
 
 		 786 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  38.35 
 
 		 789 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 782 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 785 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 		 852 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 767 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  33.74 
 
 		 769 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 814 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 850 aa  233  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 824 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 793 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 860 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 864 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 812 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 843 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 859 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 837 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 805 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 862 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 789 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 703 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 711 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 825 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 825 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.38 
 
 		 703 aa  184  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 817 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 807 aa  184  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 742 aa  184  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 791 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 767 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 701 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 809 aa  180  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 815 aa  178  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 794 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 730 aa  177  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 708 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  26.14 
 
 		 792 aa  174  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 734 aa  173  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  23.74 
 
 		 708 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.53 
 
 		 709 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  23.46 
 
 		 703 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 689 aa  170  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 766 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 741 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 692 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 698 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.5 
 
 		 696 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 736 aa  165  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 696 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 700 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 738 aa  162  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  24.08 
 
 		 781 aa  160  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 723 aa  160  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 709 aa  160  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 730 aa  160  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 724 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 722 aa  158  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 726 aa  157  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 726 aa  157  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 715 aa  157  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 786 aa  157  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 689 aa  157  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 714 aa  156  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 715 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 710 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 732 aa  155  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 710 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  25.08 
 
 		 680 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 720 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 689 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 708 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 724 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 735 aa  153  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 722 aa  153  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  24.56 
 
 		 691 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1152  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 790 aa  152  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 720 aa  151  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 701 aa  150  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  23.48 
 
 		 714 aa  150  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 720 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 806 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 792 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 719 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 710 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.11 
 
 		 689 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 689 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 757 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 706 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 797 aa  145  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 790 aa  144  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 707 aa  144  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>