More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0816 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  45.24 
 
 		 810 aa  682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 816 aa  1668    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  63.29 
 
 		 806 aa  1063    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  50.43 
 
 		 809 aa  803    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  42.41 
 
 		 808 aa  634  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  42.62 
 
 		 810 aa  630  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  39.43 
 
 		 907 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  38.97 
 
 		 786 aa  519  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  37.38 
 
 		 795 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  39.12 
 
 		 789 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  37.86 
 
 		 769 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 		 782 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  35.85 
 
 		 852 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 785 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 767 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 812 aa  251  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 791 aa  251  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 814 aa  230  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 809 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 859 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 795 aa  200  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 850 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 794 aa  191  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  25.06 
 
 		 789 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 807 aa  184  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 805 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 793 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 786 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 860 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 843 aa  170  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 815 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 781 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 730 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  25.09 
 
 		 792 aa  163  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 864 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 862 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 837 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 701 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 710 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 770 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 797 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  25.03 
 
 		 691 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 710 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 700 aa  147  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 824 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 766 aa  144  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 817 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 741 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 689 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 713 aa  140  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25.14 
 
 		 713 aa  140  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 743 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25 
 
 		 713 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.84 
 
 		 703 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 734 aa  138  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  23.64 
 
 		 801 aa  138  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 708 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 738 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 745 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  23.35 
 
 		 806 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 703 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  24.27 
 
 		 730 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  23.04 
 
 		 709 aa  134  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  23.49 
 
 		 723 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 714 aa  132  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 722 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 711 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 		 701 aa  131  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 722 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 715 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  22.83 
 
 		 825 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.39 
 
 		 696 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  22.44 
 
 		 698 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 713 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  22.87 
 
 		 708 aa  128  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  23.78 
 
 		 680 aa  127  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  21.99 
 
 		 709 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  23.54 
 
 		 728 aa  127  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  22.73 
 
 		 703 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 720 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 689 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 696 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  21.87 
 
 		 799 aa  126  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 724 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 724 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 723 aa  125  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  22.17 
 
 		 825 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 794 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  23.13 
 
 		 727 aa  125  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  22.18 
 
 		 689 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 732 aa  124  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  24.69 
 
 		 699 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 715 aa  124  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 719 aa  124  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 720 aa  124  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 714 aa  124  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 722 aa  123  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  21.82 
 
 		 708 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 701 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>