More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4959 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  51.6 
 
 		 706 aa  733    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 706 aa  1447    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  51.26 
 
 		 701 aa  722    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  52.37 
 
 		 690 aa  723    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  55.69 
 
 		 712 aa  761    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  54.34 
 
 		 712 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  52.15 
 
 		 706 aa  741    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  52.03 
 
 		 702 aa  735    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  52.37 
 
 		 703 aa  743    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  53.13 
 
 		 709 aa  748    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  54.13 
 
 		 710 aa  766    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  52.71 
 
 		 709 aa  740    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  52.39 
 
 		 697 aa  737    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  53.45 
 
 		 697 aa  749    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  52.08 
 
 		 706 aa  741    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  53.38 
 
 		 714 aa  761    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  46.1 
 
 		 690 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  45.03 
 
 		 699 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  43.38 
 
 		 693 aa  548  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  36.32 
 
 		 693 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 796 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 809 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.44 
 
 		 709 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 796 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 706 aa  196  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 706 aa  196  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 796 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 860 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 850 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 825 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 719 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 825 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 792 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 711 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.27 
 
 		 708 aa  188  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 708 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 708 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 817 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 726 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 726 aa  185  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 723 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 710 aa  183  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 863 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 702 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 817 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.45 
 
 		 695 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 710 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 713 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.35 
 
 		 713 aa  180  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 721 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 715 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 702 aa  179  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 881 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.75 
 
 		 711 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 881 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 882 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.22 
 
 		 703 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 707 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 742 aa  177  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 743 aa  177  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 701 aa  177  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 795 aa  177  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 713 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 726 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 693 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.02 
 
 		 713 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  24.84 
 
 		 743 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 689 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 679 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  25.07 
 
 		 716 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 881 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 921 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 921 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 734 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 737 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 862 aa  174  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 795 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 708 aa  173  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 791 aa  173  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 766 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  27.44 
 
 		 791 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.78 
 
 		 833 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 778 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 815 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 705 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 837 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.92 
 
 		 706 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 724 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 738 aa  172  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 729 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 738 aa  171  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 711 aa  171  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 710 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 781 aa  170  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 778 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 698 aa  170  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 710 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 779 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 794 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>