More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_4042 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  82.15 
 
 		 706 aa  1217    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  52.39 
 
 		 706 aa  737    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  80.29 
 
 		 690 aa  1161    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  70.58 
 
 		 712 aa  1031    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  71.73 
 
 		 714 aa  1064    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  73.49 
 
 		 712 aa  1031    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  62.2 
 
 		 697 aa  934    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  81.59 
 
 		 706 aa  1207    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  82.01 
 
 		 706 aa  1213    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  70.06 
 
 		 710 aa  1022    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  85.92 
 
 		 703 aa  1268    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  83.78 
 
 		 709 aa  1237    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  83.5 
 
 		 709 aa  1231    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 697 aa  1436    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  80.8 
 
 		 701 aa  1196    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  84.76 
 
 		 702 aa  1259    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  44.16 
 
 		 690 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  43.4 
 
 		 699 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  39.18 
 
 		 693 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  35.65 
 
 		 693 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 		 710 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 710 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 770 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 706 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 706 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 721 aa  214  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 742 aa  203  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 738 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.37 
 
 		 724 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 710 aa  201  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 742 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 796 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 748 aa  200  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 748 aa  200  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 850 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 860 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.83 
 
 		 695 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 740 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.83 
 
 		 708 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 726 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 726 aa  198  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 743 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 708 aa  197  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 796 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 796 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 737 aa  196  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 743 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 707 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.66 
 
 		 711 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 795 aa  194  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 795 aa  193  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 689 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.46 
 
 		 703 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 815 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 701 aa  190  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 710 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 694 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 701 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 701 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 711 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 701 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 701 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 779 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 708 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 715 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.85 
 
 		 696 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 792 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 707 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 862 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 696 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.47 
 
 		 709 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 714 aa  185  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 719 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 701 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 742 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 742 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  27.32 
 
 		 721 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 677 aa  184  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 757 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 714 aa  183  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.4 
 
 		 706 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 698 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 719 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.77 
 
 		 703 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 738 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 708 aa  181  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 745 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 712 aa  180  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 764 aa  180  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 810 aa  180  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.59 
 
 		 713 aa  180  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 714 aa  180  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 747 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.81 
 
 		 713 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 741 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>