More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1814 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  100 
 
 		 693 aa  1437    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  41.03 
 
 		 690 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  39.61 
 
 		 693 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  39.66 
 
 		 710 aa  489  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 		 712 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  39 
 
 		 699 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  39.31 
 
 		 712 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  38.13 
 
 		 714 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 706 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  36.94 
 
 		 706 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  36.94 
 
 		 706 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  36.48 
 
 		 697 aa  438  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  37.32 
 
 		 703 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  36.89 
 
 		 701 aa  435  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  36.48 
 
 		 702 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  36.48 
 
 		 690 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  36.24 
 
 		 706 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 		 709 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  35.3 
 
 		 709 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  35.65 
 
 		 697 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 707 aa  224  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 721 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 815 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.86 
 
 		 724 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.62 
 
 		 708 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 708 aa  203  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 723 aa  200  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 860 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  25.83 
 
 		 716 aa  197  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 677 aa  196  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 850 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 714 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 726 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 714 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 719 aa  194  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.85 
 
 		 703 aa  194  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25.76 
 
 		 713 aa  194  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25.76 
 
 		 713 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 825 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 825 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 743 aa  187  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 708 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 859 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  27.62 
 
 		 699 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 710 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.99 
 
 		 689 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 817 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.77 
 
 		 833 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 696 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.53 
 
 		 696 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 710 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 710 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 718 aa  179  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 726 aa  178  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 726 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 796 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 711 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.62 
 
 		 709 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 770 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 715 aa  177  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.47 
 
 		 695 aa  177  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 734 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 708 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 737 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  25.87 
 
 		 729 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 740 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 743 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 701 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 748 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 748 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 749 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 713 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 718 aa  174  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 707 aa  173  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 706 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 706 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 715 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 778 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 753 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 738 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.29 
 
 		 703 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 809 aa  172  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 699 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 766 aa  171  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 738 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 694 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 701 aa  170  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 701 aa  170  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 722 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.62 
 
 		 706 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  25.99 
 
 		 711 aa  170  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 778 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 817 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 711 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 742 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 742 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 705 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 715 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 742 aa  168  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 710 aa  168  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>