More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3641 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  64.31 
 
 		 702 aa  947    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  53.45 
 
 		 706 aa  749    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  65.08 
 
 		 690 aa  923    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  62.03 
 
 		 712 aa  904    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  64.23 
 
 		 706 aa  941    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  61.81 
 
 		 714 aa  926    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  64.64 
 
 		 703 aa  962    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  65.06 
 
 		 701 aa  956    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  64.23 
 
 		 706 aa  941    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  61.99 
 
 		 710 aa  916    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  63.94 
 
 		 706 aa  936    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  61.8 
 
 		 712 aa  922    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  63.39 
 
 		 709 aa  939    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  63.67 
 
 		 709 aa  937    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  62.2 
 
 		 697 aa  934    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 697 aa  1427    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  44.02 
 
 		 690 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  42.51 
 
 		 699 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  39.55 
 
 		 693 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  36.48 
 
 		 693 aa  438  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 770 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 710 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 710 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  29.7 
 
 		 749 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 748 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 748 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 706 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 706 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 737 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 721 aa  211  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 738 aa  210  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 742 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 742 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 715 aa  204  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 740 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 863 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 795 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 726 aa  198  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 795 aa  198  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 719 aa  197  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 707 aa  196  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 796 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 858 aa  194  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.8 
 
 		 724 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 796 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 796 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 796 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 855 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 855 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 742 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 742 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 694 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 757 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 702 aa  187  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 715 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.45 
 
 		 711 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.22 
 
 		 706 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 719 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 742 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 810 aa  186  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 882 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 725 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 921 aa  184  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 779 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 921 aa  184  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 817 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.6 
 
 		 695 aa  183  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 708 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 689 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 881 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.6 
 
 		 705 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 679 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 778 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 710 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 881 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 881 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.66 
 
 		 709 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 850 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 809 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 708 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 705 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 707 aa  181  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 711 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 713 aa  180  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  23.52 
 
 		 812 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 792 aa  178  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.55 
 
 		 713 aa  176  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 702 aa  177  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.79 
 
 		 713 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 708 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 736 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 732 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 791 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 743 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.18 
 
 		 703 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 725 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 800 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 860 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.83 
 
 		 689 aa  174  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>