More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2386 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  82.66 
 
 		 737 aa  1271    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  83.98 
 
 		 748 aa  1294    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  60.78 
 
 		 711 aa  864    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  83.98 
 
 		 748 aa  1294    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 742 aa  1533    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  98.65 
 
 		 742 aa  1514    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  62.92 
 
 		 712 aa  887    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  93.4 
 
 		 738 aa  1436    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  82.64 
 
 		 740 aa  1270    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  83.71 
 
 		 749 aa  1291    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  44.03 
 
 		 708 aa  548  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  42.76 
 
 		 713 aa  540  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  41.23 
 
 		 714 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 814 aa  268  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 792 aa  256  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 770 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 850 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 724 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 723 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 710 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 710 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 724 aa  244  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 817 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 712 aa  238  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 707 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 720 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 766 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 824 aa  234  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 715 aa  234  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 720 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 720 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 721 aa  232  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 719 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 720 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 689 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 701 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 701 aa  230  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 757 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 722 aa  229  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 694 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 701 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 701 aa  227  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 859 aa  227  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 738 aa  226  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 714 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 707 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 701 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 701 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 715 aa  224  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.6 
 
 		 724 aa  223  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 722 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 828 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 734 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 860 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 809 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 789 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 702 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 702 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 815 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 708 aa  218  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 796 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.93 
 
 		 708 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 825 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 825 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 732 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 828 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 714 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 689 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.56 
 
 		 703 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.23 
 
 		 703 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.95 
 
 		 806 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  29.66 
 
 		 690 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.94 
 
 		 696 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 696 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 701 aa  214  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 706 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.23 
 
 		 706 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 706 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 692 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 712 aa  213  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 864 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 796 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  29.66 
 
 		 703 aa  211  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 703 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 828 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 708 aa  210  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 812 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 794 aa  210  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  29.08 
 
 		 697 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.34 
 
 		 695 aa  209  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 820 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 710 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 736 aa  208  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.69 
 
 		 711 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 821 aa  208  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 709 aa  207  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 705 aa  207  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 709 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 714 aa  207  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 711 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>