More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5029 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  50.92 
 
 		 702 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  53.49 
 
 		 705 aa  726    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  51.49 
 
 		 702 aa  689    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 708 aa  1429    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  44.82 
 
 		 698 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 751 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 743 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 743 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 743 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 		 719 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 743 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 743 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 743 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 729 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 710 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 710 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 712 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 729 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.94 
 
 		 704 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.67 
 
 		 724 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 724 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 715 aa  226  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 710 aa  226  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  28.83 
 
 		 804 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 728 aa  218  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  28.55 
 
 		 804 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 729 aa  217  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 811 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 706 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 730 aa  208  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 811 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.56 
 
 		 711 aa  206  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 804 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 708 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  28.73 
 
 		 737 aa  200  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 707 aa  200  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 722 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 772 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 753 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 772 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 707 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 726 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 707 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  30.53 
 
 		 771 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 746 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 722 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 716 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 737 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  27.35 
 
 		 744 aa  194  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 729 aa  193  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 738 aa  193  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 729 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 725 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 727 aa  191  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 774 aa  189  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 730 aa  188  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 802 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 742 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 727 aa  187  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 823 aa  187  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 761 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 726 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 718 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 727 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 710 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 768 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 742 aa  183  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 768 aa  183  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  28.14 
 
 		 763 aa  183  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 728 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  28.2 
 
 		 720 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 718 aa  181  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 706 aa  181  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 728 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 805 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 761 aa  180  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  28.2 
 
 		 730 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 715 aa  179  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 712 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 712 aa  177  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 755 aa  177  8e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 758 aa  176  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 819 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 800 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 773 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 756 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  25.94 
 
 		 697 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 734 aa  171  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  26.59 
 
 		 746 aa  171  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 714 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 712 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 809 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 808 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 801 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 772 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 801 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.1 
 
 		 713 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 706 aa  167  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.44 
 
 		 713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>