More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1424 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  91.55 
 
 		 729 aa  1315    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  91.69 
 
 		 710 aa  1319    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  65.96 
 
 		 724 aa  934    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 710 aa  1454    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  85.67 
 
 		 712 aa  1228    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  65.73 
 
 		 724 aa  929    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  49.93 
 
 		 751 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  54.4 
 
 		 704 aa  732    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  48.42 
 
 		 743 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  49.26 
 
 		 743 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  49.48 
 
 		 743 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  49.48 
 
 		 743 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  49.85 
 
 		 743 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  49.63 
 
 		 743 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  48.08 
 
 		 729 aa  620  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  39.02 
 
 		 719 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 729 aa  343  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  32.41 
 
 		 705 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.86 
 
 		 711 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 811 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 811 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 702 aa  264  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 708 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 702 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 774 aa  251  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 718 aa  246  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 727 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 708 aa  244  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 727 aa  244  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 716 aa  243  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 726 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 728 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 707 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 707 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 707 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 742 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 738 aa  230  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 706 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 802 aa  223  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 730 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 715 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 710 aa  220  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 722 aa  216  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 727 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 730 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 768 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 754 aa  210  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 800 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 801 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 823 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 801 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 728 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 805 aa  207  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 726 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 753 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  27.62 
 
 		 744 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 772 aa  204  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 772 aa  204  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 742 aa  202  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  28.26 
 
 		 804 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  28.95 
 
 		 737 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  28.61 
 
 		 746 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 755 aa  201  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 729 aa  201  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 714 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 722 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 819 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  28.42 
 
 		 771 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  28.3 
 
 		 730 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  28.11 
 
 		 804 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 808 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 762 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 777 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 729 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 809 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 734 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 685 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 712 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 725 aa  188  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 728 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 757 aa  187  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 804 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 710 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 728 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 737 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 746 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 772 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 756 aa  180  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 761 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 761 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  26.82 
 
 		 693 aa  177  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 764 aa  177  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 758 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 724 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 712 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 750 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 753 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  28.02 
 
 		 804 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 703 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>