More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0199 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  48.8 
 
 		 907 aa  785    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  44.39 
 
 		 809 aa  682    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  42.62 
 
 		 816 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  53.77 
 
 		 810 aa  867    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 810 aa  1657    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  43.01 
 
 		 808 aa  646    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 795 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  40.75 
 
 		 806 aa  609  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  41.59 
 
 		 786 aa  592  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  42.44 
 
 		 789 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  38.96 
 
 		 785 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  39.03 
 
 		 782 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 852 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  37.16 
 
 		 769 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  36.16 
 
 		 767 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 814 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 812 aa  251  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 824 aa  247  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 789 aa  245  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 807 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 791 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 809 aa  214  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 805 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 850 aa  203  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 794 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 859 aa  197  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 776 aa  195  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 793 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 795 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 843 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 862 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 864 aa  191  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 837 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  26.42 
 
 		 792 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 860 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 742 aa  183  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 781 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 689 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 815 aa  173  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 817 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 825 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 766 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  23.86 
 
 		 708 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 		 825 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 741 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 707 aa  168  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 767 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 713 aa  167  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 806 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 711 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  23.58 
 
 		 703 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25.36 
 
 		 713 aa  163  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25.36 
 
 		 713 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.68 
 
 		 709 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 710 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  22.98 
 
 		 730 aa  159  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 710 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 770 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 696 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 715 aa  157  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.66 
 
 		 696 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  23.22 
 
 		 743 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 821 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 		 726 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 708 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 819 aa  153  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 726 aa  153  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 709 aa  151  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 723 aa  151  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 734 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 708 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 727 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  26.45 
 
 		 691 aa  149  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 730 aa  149  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 769 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 771 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  23.99 
 
 		 801 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.41 
 
 		 713 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 703 aa  145  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 799 aa  144  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 707 aa  144  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.4 
 
 		 703 aa  144  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  23.03 
 
 		 757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 722 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  24.59 
 
 		 799 aa  142  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  23.22 
 
 		 743 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 709 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 709 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 736 aa  142  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  23.04 
 
 		 744 aa  142  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 732 aa  140  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 709 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  23.04 
 
 		 744 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 738 aa  140  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  24.25 
 
 		 693 aa  140  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 796 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 701 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 792 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 724 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 701 aa  138  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>