More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5324 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5324  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 710 aa  1468    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0890511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 807 aa  284  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 781 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 793 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 805 aa  273  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 791 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 794 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 850 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 862 aa  190  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 859 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 815 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 843 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 778 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 817 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 817 aa  183  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 701 aa  180  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 837 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 864 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 701 aa  174  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 701 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 708 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 701 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  25.91 
 
 		 791 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 710 aa  171  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 860 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 791 aa  171  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 705 aa  170  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 701 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 722 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 723 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.12 
 
 		 713 aa  167  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.35 
 
 		 708 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 701 aa  168  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 701 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 701 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  27.37 
 
 		 808 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 799 aa  167  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 721 aa  167  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 724 aa  167  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 722 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.64 
 
 		 689 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 724 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  23.65 
 
 		 691 aa  165  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.28 
 
 		 703 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.09 
 
 		 703 aa  164  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  26.28 
 
 		 729 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 789 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 696 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  24.96 
 
 		 799 aa  161  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  24.85 
 
 		 801 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 703 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 743 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 806 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 757 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 829 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.11 
 
 		 833 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 828 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 719 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 726 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 696 aa  158  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 831 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 712 aa  156  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 828 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 825 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 720 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 713 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 740 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 707 aa  154  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 692 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 720 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 825 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 714 aa  154  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 720 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 730 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  25.56 
 
 		 703 aa  153  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 710 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 724 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 828 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 727 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 797 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 701 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 722 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 701 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 709 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 828 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 711 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 720 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.23 
 
 		 711 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 819 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 748 aa  152  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 714 aa  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  24.59 
 
 		 696 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  24.43 
 
 		 716 aa  152  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 707 aa  151  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 742 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  28.62 
 
 		 738 aa  151  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  24.74 
 
 		 696 aa  151  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 741 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 734 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>