More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2008 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 833 aa  1722    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  40.27 
 
 		 848 aa  581  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 778 aa  457  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 763 aa  452  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 719 aa  265  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 760 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 748 aa  184  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 753 aa  179  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  26.49 
 
 		 750 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  23.51 
 
 		 720 aa  144  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 720 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 720 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 720 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 757 aa  122  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 747 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 836 aa  119  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  27.97 
 
 		 691 aa  112  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  34.85 
 
 		 783 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 687 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 828 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 700 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 798 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  27.78 
 
 		 799 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 893 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 634 aa  102  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 688 aa  101  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 734 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 733 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 815 aa  99.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 814 aa  98.6  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  27.02 
 
 		 782 aa  96.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 845 aa  95.9  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 751 aa  95.9  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 918 aa  94.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 907 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 806 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 745 aa  92  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 721 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  34.27 
 
 		 677 aa  91.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 952 aa  91.3  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 713 aa  90.5  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 649 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 828 aa  90.1  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 962 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 866 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.87 
 
 		 650 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  23.75 
 
 		 726 aa  89.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 810 aa  89  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1147 aa  88.6  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  30.22 
 
 		 633 aa  88.2  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 991 aa  88.2  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 791 aa  88.2  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.77 
 
 		 647 aa  87.8  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  38.13 
 
 		 668 aa  87.4  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 817 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 698 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 809 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 1128 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  27 
 
 		 797 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  24.87 
 
 		 650 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 933 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  23.91 
 
 		 651 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.7 
 
 		 650 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.7 
 
 		 650 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 663 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.87 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.11 
 
 		 663 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.11 
 
 		 663 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 773 aa  85.9  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.11 
 
 		 663 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.11 
 
 		 663 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 682 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.11 
 
 		 663 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.08 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  31.8 
 
 		 655 aa  85.1  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 681 aa  84.3  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.97 
 
 		 639 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 824 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.95 
 
 		 659 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 801 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  33.86 
 
 		 618 aa  83.2  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 769 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 707 aa  83.2  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 861 aa  82.4  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 772 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 852 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  33.16 
 
 		 614 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.16 
 
 		 614 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 789 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1089 aa  82  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.16 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 818 aa  81.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.16 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 1047 aa  81.6  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 657 aa  81.6  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  31.53 
 
 		 739 aa  81.6  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  36.92 
 
 		 650 aa  81.3  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.64 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 613 aa  80.9  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>