More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1260 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 866 aa  1766    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 786 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 882 aa  395  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 835 aa  355  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  29.86 
 
 		 959 aa  304  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 798 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 798 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 798 aa  302  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 798 aa  302  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 798 aa  302  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 798 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  31.67 
 
 		 798 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 793 aa  293  7e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 814 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 864 aa  283  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 798 aa  278  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 753 aa  277  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  30.05 
 
 		 756 aa  277  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 761 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 757 aa  261  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 812 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 831 aa  257  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 836 aa  257  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 870 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 754 aa  249  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 923 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 815 aa  237  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 798 aa  218  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 875 aa  216  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 879 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 838 aa  171  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  29.66 
 
 		 750 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 791 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 812 aa  97.4  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 757 aa  94.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 798 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 		 809 aa  93.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1075 aa  92  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 795 aa  92  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 757 aa  92  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 814 aa  91.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 805 aa  91.3  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 769 aa  91.3  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 816 aa  90.9  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 893 aa  90.5  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  30.13 
 
 		 833 aa  89.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  22.55 
 
 		 789 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 806 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 810 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 988 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 836 aa  88.2  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 809 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 776 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 791 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 769 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 807 aa  86.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 748 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 810 aa  84.7  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1019 aa  84.7  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 760 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 785 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.74 
 
 		 788 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  26.07 
 
 		 808 aa  83.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 737 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 778 aa  82.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 958 aa  82.4  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  21.73 
 
 		 782 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 1004 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1020 aa  82  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1066 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1085 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  27.78 
 
 		 872 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5532  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1092 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0182385  normal  0.924407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  26.86 
 
 		 797 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  27.57 
 
 		 811 aa  79.7  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 795 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  22.1 
 
 		 789 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 828 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 779 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 817 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 1055 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 938 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 907 aa  78.2  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 852 aa  77.8  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 828 aa  77.8  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1194 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 1011 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1147 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  27.12 
 
 		 942 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 735 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 1056 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 793 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  21.66 
 
 		 767 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  22.92 
 
 		 792 aa  75.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1154 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 753 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 783 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  22.19 
 
 		 824 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  23.83 
 
 		 848 aa  75.1  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1047 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>