More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2516 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  48.12 
 
 		 799 aa  707    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  54.58 
 
 		 791 aa  839    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  51.29 
 
 		 797 aa  764    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 772 aa  1560    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 798 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  36.83 
 
 		 713 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  36.57 
 
 		 782 aa  442  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 792 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1117 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 763 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  30.89 
 
 		 781 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 823 aa  286  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  28.59 
 
 		 767 aa  281  5e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.88 
 
 		 788 aa  271  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  29.27 
 
 		 960 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 748 aa  94.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 760 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 776 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 795 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  30.43 
 
 		 750 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 753 aa  88.2  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 917 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1040 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 747 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1036 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 845 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.72 
 
 		 833 aa  82.4  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 942 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 932 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 836 aa  81.3  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 962 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 828 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 757 aa  79  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 763 aa  79  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 938 aa  78.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 806 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1066 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 786 aa  74.7  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 982 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 1004 aa  74.3  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 882 aa  74.3  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 920 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 962 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 828 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1061 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1148 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 1040 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1102 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  38.32 
 
 		 409 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 854 aa  71.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 721 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 785 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 767 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.76 
 
 		 848 aa  70.5  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 833 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 783 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 817 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 778 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 642 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 866 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 642 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1047 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 1065 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1068 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1019 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  29.05 
 
 		 1047 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 782 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 769 aa  68.6  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1085 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 1065 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 924 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  39.33 
 
 		 618 aa  67.8  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 647 aa  67.8  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 986 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 988 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.28 
 
 		 1023 aa  67.8  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1008 aa  67.8  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 757 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 1089 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1071 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 698 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1081 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 789 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 815 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 653 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1051 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 760 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 851 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 735 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1033 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1066 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1125 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 943 aa  65.1  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1076 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.14 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1096 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 861 aa  65.1  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1082 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 848 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>