More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0464 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
748 aa  1541    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  55.06 
 
 
753 aa  853    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  52.7 
 
 
760 aa  775    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  61.97 
 
 
750 aa  966    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 
763 aa  216  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  25 
 
 
745 aa  201  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
751 aa  200  7e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 
773 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.96 
 
 
833 aa  184  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 
778 aa  169  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.51 
 
 
848 aa  161  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 
668 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 
772 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 
719 aa  145  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 
733 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  25.19 
 
 
726 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
734 aa  131  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 
721 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 
713 aa  125  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 
747 aa  118  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 
688 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 
740 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  22.1 
 
 
720 aa  112  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 
720 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  25.05 
 
 
680 aa  111  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.76 
 
 
640 aa  111  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
661 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 
757 aa  109  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 
739 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.37 
 
 
656 aa  107  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
635 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 
613 aa  105  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
795 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 
828 aa  103  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  22.13 
 
 
653 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 
807 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 
662 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.89 
 
 
663 aa  101  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 
751 aa  101  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
662 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 
663 aa  100  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.89 
 
 
663 aa  100  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.89 
 
 
659 aa  100  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
662 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.89 
 
 
663 aa  100  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
680 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  25.89 
 
 
641 aa  100  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 
798 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.68 
 
 
663 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.56 
 
 
650 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.56 
 
 
650 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.56 
 
 
650 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.56 
 
 
650 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.15 
 
 
695 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 
776 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.68 
 
 
663 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.46 
 
 
650 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 
845 aa  99  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 
658 aa  99  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.55 
 
 
633 aa  98.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  24.52 
 
 
665 aa  97.8  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 
649 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.04 
 
 
653 aa  96.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 
791 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
824 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
698 aa  96.3  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
698 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
698 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 
653 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  25 
 
 
704 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.75 
 
 
652 aa  94.4  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 
772 aa  94.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 
836 aa  94.4  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  23.22 
 
 
687 aa  94.4  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  21.19 
 
 
676 aa  94  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.71 
 
 
661 aa  94  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  23.23 
 
 
650 aa  93.2  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 
769 aa  93.6  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.87 
 
 
631 aa  92.8  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.95 
 
 
631 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  22.91 
 
 
807 aa  92.4  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
649 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  30 
 
 
811 aa  91.3  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  28.42 
 
 
788 aa  91.3  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  26.86 
 
 
799 aa  90.9  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.12 
 
 
656 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  25 
 
 
1128 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  36.76 
 
 
677 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  30.95 
 
 
782 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 
791 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  38.06 
 
 
732 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  25 
 
 
828 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.3 
 
 
631 aa  89.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.27 
 
 
619 aa  88.2  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 
642 aa  88.2  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 
720 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  23.23 
 
 
691 aa  88.2  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 
795 aa  88.2  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
679 aa  88.2  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 
624 aa  87.8  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>