More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0562 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  100 
 
 
634 aa  1293    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  43.99 
 
 
639 aa  521  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  35.94 
 
 
633 aa  356  8.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 
613 aa  238  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 
699 aa  217  5e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  28.91 
 
 
653 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 
706 aa  210  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  28.59 
 
 
635 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 
649 aa  204  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 
653 aa  203  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 
661 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 
662 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 
649 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 
662 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 
662 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 
680 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 
650 aa  197  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 
649 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  29.56 
 
 
640 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  28.88 
 
 
650 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  27.37 
 
 
659 aa  184  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  28.73 
 
 
650 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
657 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  28.73 
 
 
650 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  27.88 
 
 
663 aa  182  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  28.73 
 
 
650 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 
663 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  27.44 
 
 
663 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  27.44 
 
 
663 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  27.44 
 
 
663 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  27.44 
 
 
663 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  28.57 
 
 
650 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.74 
 
 
646 aa  180  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  28.02 
 
 
641 aa  180  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0385  TonB-dependent receptor, plug  27.65 
 
 
713 aa  179  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  27.23 
 
 
656 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.35 
 
 
656 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 
648 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 
665 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 
651 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  27.55 
 
 
700 aa  167  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
649 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  28.02 
 
 
653 aa  163  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  27.69 
 
 
665 aa  163  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  28.49 
 
 
666 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.86 
 
 
623 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 
698 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  28.34 
 
 
666 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 
652 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  28.38 
 
 
666 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  28.17 
 
 
666 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  28.17 
 
 
666 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 
614 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
697 aa  157  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  29.12 
 
 
620 aa  156  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.3 
 
 
1023 aa  156  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 
743 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  27.09 
 
 
638 aa  154  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.46 
 
 
696 aa  153  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  26.02 
 
 
704 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  28.89 
 
 
663 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
702 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  26.81 
 
 
650 aa  152  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  27.85 
 
 
676 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  28.53 
 
 
697 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  27.9 
 
 
618 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  28.98 
 
 
663 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 
657 aa  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 
688 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.31 
 
 
696 aa  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  28.17 
 
 
616 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  26.76 
 
 
655 aa  150  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  25.43 
 
 
757 aa  150  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
698 aa  150  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
698 aa  150  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
698 aa  150  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.73 
 
 
631 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
694 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 
626 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.03 
 
 
613 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.11 
 
 
631 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.02 
 
 
695 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.89 
 
 
617 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
676 aa  148  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  27 
 
 
626 aa  147  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
611 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
627 aa  146  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 
624 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.17 
 
 
623 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
679 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  26.17 
 
 
744 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 
695 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  24.64 
 
 
746 aa  144  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
714 aa  143  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.19 
 
 
616 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  25.9 
 
 
744 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  25.81 
 
 
746 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
621 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0449  hypothetical protein  46.3 
 
 
234 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>