More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0928 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  58.31 
 
 		 753 aa  891    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  61.97 
 
 		 748 aa  966    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  50.39 
 
 		 760 aa  749    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 750 aa  1526    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 763 aa  191  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 745 aa  190  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 773 aa  167  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.49 
 
 		 833 aa  166  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 772 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 721 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 751 aa  145  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 778 aa  145  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 713 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  35.56 
 
 		 848 aa  139  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 719 aa  137  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 733 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 668 aa  136  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  24.69 
 
 		 726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 734 aa  128  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 634 aa  125  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  21.88 
 
 		 747 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  22.46 
 
 		 720 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  25.69 
 
 		 680 aa  116  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 720 aa  114  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 720 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 740 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 757 aa  108  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 798 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 720 aa  106  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 687 aa  105  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  25.27 
 
 		 700 aa  104  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 866 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  25.95 
 
 		 691 aa  103  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 702 aa  102  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 1128 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 688 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.67 
 
 		 639 aa  102  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.96 
 
 		 659 aa  101  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  24.03 
 
 		 739 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  28.86 
 
 		 788 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.81 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.81 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.81 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.08 
 
 		 656 aa  100  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.66 
 
 		 663 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 635 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.81 
 
 		 641 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.66 
 
 		 663 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.45 
 
 		 653 aa  99  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  25 
 
 		 704 aa  99  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 698 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  28.57 
 
 		 799 aa  95.9  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 613 aa  96.3  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.5 
 
 		 633 aa  94.4  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 697 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.27 
 
 		 650 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  24.42 
 
 		 650 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 735 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.01 
 
 		 647 aa  91.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  35.67 
 
 		 640 aa  91.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.19 
 
 		 650 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 647 aa  91.3  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.12 
 
 		 650 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  22.65 
 
 		 611 aa  91.3  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  22.54 
 
 		 665 aa  90.9  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.37 
 
 		 656 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  25.1 
 
 		 651 aa  90.1  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.06 
 
 		 652 aa  89.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  33.65 
 
 		 782 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 772 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 799 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 799 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 809 aa  88.6  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  31.2 
 
 		 811 aa  88.2  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 828 aa  87.8  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 845 aa  87.8  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.63 
 
 		 631 aa  87.4  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 612 aa  87  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 715 aa  87  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 792 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 807 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 799 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 795 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 658 aa  86.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  24.06 
 
 		 668 aa  85.5  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 659 aa  85.1  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  33.83 
 
 		 613 aa  85.1  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.09 
 
 		 631 aa  84.3  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  23.14 
 
 		 744 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  23.42 
 
 		 744 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.39 
 
 		 631 aa  83.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.33 
 
 		 619 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 836 aa  83.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 682 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 616 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>