More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6730 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  81.44 
 
 		 734 aa  1245    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 733 aa  1503    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 721 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  32.03 
 
 		 726 aa  364  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  29.75 
 
 		 700 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  29.35 
 
 		 691 aa  243  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  28.7 
 
 		 687 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 748 aa  137  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.33 
 
 		 750 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 760 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 719 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 634 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 751 aa  127  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 613 aa  120  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 763 aa  117  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 772 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.58 
 
 		 639 aa  111  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 773 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.27 
 
 		 848 aa  110  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 720 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.29 
 
 		 665 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  24.29 
 
 		 665 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 720 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.29 
 
 		 665 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  23.32 
 
 		 720 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 694 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 778 aa  109  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.89 
 
 		 656 aa  109  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  22.38 
 
 		 665 aa  108  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.57 
 
 		 633 aa  108  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.47 
 
 		 680 aa  108  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 668 aa  107  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 688 aa  106  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 745 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.06 
 
 		 653 aa  104  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 681 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.47 
 
 		 663 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.71 
 
 		 663 aa  101  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.47 
 
 		 663 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 663 aa  100  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.47 
 
 		 663 aa  100  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.47 
 
 		 663 aa  100  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.47 
 
 		 659 aa  100  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.56 
 
 		 650 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 665 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 679 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  22.89 
 
 		 833 aa  99.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.47 
 
 		 641 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 707 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.33 
 
 		 650 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.33 
 
 		 650 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.33 
 
 		 650 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.33 
 
 		 650 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 647 aa  96.3  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 707 aa  96.3  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  27.11 
 
 		 656 aa  95.5  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 		 636 aa  95.1  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.56 
 
 		 655 aa  93.6  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 713 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  23.87 
 
 		 668 aa  93.2  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 652 aa  91.7  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 698 aa  91.3  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 762 aa  90.9  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 715 aa  90.5  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 1128 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 653 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 635 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.54 
 
 		 695 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 757 aa  87.4  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 679 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  24.15 
 
 		 696 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  24.12 
 
 		 676 aa  85.5  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.01 
 
 		 652 aa  85.5  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  26.36 
 
 		 572 aa  85.1  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  23.85 
 
 		 702 aa  84.3  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  25.17 
 
 		 666 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  25.17 
 
 		 666 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  25.17 
 
 		 666 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  22.86 
 
 		 623 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  22.79 
 
 		 650 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  25.47 
 
 		 646 aa  82.4  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 726 aa  82.4  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.94 
 
 		 666 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.23 
 
 		 746 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 769 aa  81.6  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 713 aa  81.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  22.69 
 
 		 706 aa  80.9  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 861 aa  80.9  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0993  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 735 aa  80.9  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0663099  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  23.29 
 
 		 677 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.66 
 
 		 663 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 611 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 634 aa  80.1  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  25 
 
 		 666 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 817 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  22.97 
 
 		 685 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  22.97 
 
 		 685 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  22.97 
 
 		 685 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>