More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1631 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 739 aa  1477    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  47.25 
 
 		 680 aa  571  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  33.7 
 
 		 655 aa  362  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  34.86 
 
 		 676 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  33.23 
 
 		 663 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  35.11 
 
 		 653 aa  324  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  32 
 
 		 665 aa  323  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  32 
 
 		 665 aa  323  8e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  31.85 
 
 		 665 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  32.25 
 
 		 665 aa  319  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  33.13 
 
 		 663 aa  319  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  33.38 
 
 		 666 aa  317  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  33.08 
 
 		 666 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  32.78 
 
 		 666 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  33.68 
 
 		 652 aa  313  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  32.78 
 
 		 666 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  32.63 
 
 		 666 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 715 aa  306  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 726 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 652 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 658 aa  293  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  30.22 
 
 		 656 aa  291  3e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 740 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 664 aa  280  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.43 
 
 		 696 aa  278  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 702 aa  278  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.43 
 
 		 696 aa  278  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.53 
 
 		 656 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 713 aa  273  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 698 aa  267  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  33.19 
 
 		 700 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.37 
 
 		 695 aa  266  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 698 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 698 aa  261  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 698 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  31.17 
 
 		 650 aa  258  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  31.33 
 
 		 650 aa  257  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  31.02 
 
 		 650 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  31.17 
 
 		 650 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 714 aa  250  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  30.71 
 
 		 650 aa  250  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 649 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 743 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.01 
 
 		 656 aa  248  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  29.32 
 
 		 663 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 663 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  29.66 
 
 		 659 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  29.32 
 
 		 663 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  29.32 
 
 		 663 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  29.32 
 
 		 663 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  29.17 
 
 		 663 aa  238  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  29.17 
 
 		 641 aa  236  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 799 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  27.32 
 
 		 698 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 799 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 799 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  27.72 
 
 		 702 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 653 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  29.06 
 
 		 696 aa  230  8e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 635 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 665 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  26.99 
 
 		 704 aa  221  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 697 aa  221  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  30.43 
 
 		 732 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  27.13 
 
 		 696 aa  219  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 661 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  29.35 
 
 		 572 aa  213  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 649 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 662 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 662 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 662 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 680 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 649 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 653 aa  207  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  28.48 
 
 		 640 aa  204  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 681 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1811  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  31.14 
 
 		 330 aa  180  9e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 648 aa  177  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  27.66 
 
 		 746 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  27.34 
 
 		 744 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  26.43 
 
 		 746 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 657 aa  169  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  27.98 
 
 		 744 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  26.01 
 
 		 703 aa  168  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  27.19 
 
 		 744 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  27.1 
 
 		 757 aa  161  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  26.62 
 
 		 766 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  27.97 
 
 		 749 aa  158  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  25.92 
 
 		 783 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  45.16 
 
 		 806 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  25.14 
 
 		 740 aa  153  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  28.84 
 
 		 661 aa  151  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 804 aa  150  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  27.35 
 
 		 746 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.12 
 
 		 742 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  26.12 
 
 		 724 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  38.57 
 
 		 326 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  26.4 
 
 		 751 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  26.92 
 
 		 746 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  26.4 
 
 		 751 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>