More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3815 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  100 
 
 
658 aa  1358    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  47.95 
 
 
666 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  47.28 
 
 
666 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  48.31 
 
 
663 aa  621  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  47.43 
 
 
666 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  48.42 
 
 
666 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  47.28 
 
 
666 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  48.49 
 
 
663 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  46.78 
 
 
653 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  44.79 
 
 
652 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  44.46 
 
 
652 aa  545  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  42.03 
 
 
665 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  42.5 
 
 
665 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  42.5 
 
 
665 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  42.5 
 
 
665 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  41.53 
 
 
655 aa  495  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.78 
 
 
656 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  37.44 
 
 
740 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 
726 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  36.21 
 
 
698 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  36.09 
 
 
700 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  37.87 
 
 
732 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  35.98 
 
 
676 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  35.15 
 
 
659 aa  353  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 
713 aa  353  5.9999999999999994e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 
743 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  34.91 
 
 
572 aa  352  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  35.09 
 
 
663 aa  352  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 
663 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  35.09 
 
 
641 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  35.09 
 
 
663 aa  351  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  35.09 
 
 
663 aa  351  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  35.09 
 
 
663 aa  352  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  34.94 
 
 
663 aa  351  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.93 
 
 
650 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.29 
 
 
656 aa  343  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.43 
 
 
650 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  33.78 
 
 
650 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  33.78 
 
 
650 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.78 
 
 
650 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.27 
 
 
695 aa  340  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.76 
 
 
696 aa  336  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.76 
 
 
696 aa  335  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  35.14 
 
 
680 aa  329  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  33 
 
 
698 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  33 
 
 
698 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  33 
 
 
698 aa  325  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
702 aa  323  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 
799 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 
799 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  33.54 
 
 
656 aa  319  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 
665 aa  312  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 
799 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 
664 aa  311  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 
715 aa  307  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 
714 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  32.31 
 
 
739 aa  293  8e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.98 
 
 
635 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  32.67 
 
 
653 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 
681 aa  287  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  31.41 
 
 
696 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 
806 aa  278  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  29.99 
 
 
702 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 
657 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  30.13 
 
 
698 aa  266  1e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 
648 aa  261  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  29.02 
 
 
696 aa  256  9e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 
661 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 
662 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 
680 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 
662 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  28.02 
 
 
697 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 
662 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
653 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 
649 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 
649 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  28.76 
 
 
704 aa  238  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  27.74 
 
 
742 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  27.08 
 
 
742 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 
649 aa  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  28.81 
 
 
746 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  28.81 
 
 
746 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  28.35 
 
 
640 aa  223  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  28.75 
 
 
759 aa  222  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  27.67 
 
 
740 aa  217  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  27.29 
 
 
703 aa  216  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  26.68 
 
 
757 aa  216  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 
650 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  28.02 
 
 
746 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  28.16 
 
 
746 aa  211  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  26.88 
 
 
746 aa  210  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  27.87 
 
 
746 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  27.87 
 
 
746 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  27.87 
 
 
746 aa  209  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  27.87 
 
 
746 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  27.22 
 
 
750 aa  208  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  27.87 
 
 
746 aa  208  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  26.59 
 
 
724 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  27.89 
 
 
751 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  25.47 
 
 
749 aa  208  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>