More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4281 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  51.98 
 
 
740 aa  698    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  50.35 
 
 
713 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  54.67 
 
 
698 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  100 
 
 
700 aa  1416    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  43.47 
 
 
656 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  40.86 
 
 
653 aa  479  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  39.29 
 
 
655 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  38.97 
 
 
666 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  38.61 
 
 
663 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  38.75 
 
 
666 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  39 
 
 
666 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  39 
 
 
666 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  38.71 
 
 
666 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  37.96 
 
 
663 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  38.63 
 
 
652 aa  438  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  37.25 
 
 
665 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 
652 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  37.2 
 
 
665 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  37.2 
 
 
665 aa  419  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  37.2 
 
 
665 aa  419  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 
658 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 
743 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  36.17 
 
 
732 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 
726 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  36.51 
 
 
676 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 
702 aa  365  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 
698 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 
698 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 
698 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  36.02 
 
 
680 aa  354  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 
715 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 
799 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.24 
 
 
696 aa  340  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.24 
 
 
696 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 
714 aa  339  9e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 
799 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.42 
 
 
695 aa  337  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
799 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 
806 aa  328  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 
664 aa  325  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.85 
 
 
650 aa  323  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.85 
 
 
650 aa  323  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.85 
 
 
650 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  33.71 
 
 
656 aa  322  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.71 
 
 
650 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.85 
 
 
650 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  33.62 
 
 
659 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  33.95 
 
 
663 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  33.95 
 
 
663 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 
663 aa  320  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  33.95 
 
 
663 aa  320  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  33.95 
 
 
663 aa  320  7e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  33.38 
 
 
663 aa  318  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 
656 aa  315  2.9999999999999996e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  34.27 
 
 
641 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  34.34 
 
 
572 aa  301  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 
665 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  29.39 
 
 
696 aa  291  2e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  30.08 
 
 
698 aa  290  6e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 
681 aa  286  9e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  29.67 
 
 
702 aa  285  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  32.95 
 
 
739 aa  272  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 
661 aa  270  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 
649 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 
662 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 
662 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 
680 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 
662 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  29.4 
 
 
704 aa  263  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 
653 aa  262  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  28.36 
 
 
696 aa  261  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 
649 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  27.61 
 
 
697 aa  259  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  31.75 
 
 
653 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 
649 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  31.02 
 
 
635 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  29.18 
 
 
640 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
648 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 
657 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  28.25 
 
 
749 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 
650 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  27 
 
 
703 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  28.08 
 
 
744 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  28.14 
 
 
744 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  26.57 
 
 
740 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  27.56 
 
 
744 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  40.19 
 
 
326 aa  204  5e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  27.7 
 
 
746 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  27.67 
 
 
746 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  27.83 
 
 
746 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  26.9 
 
 
750 aa  196  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  27.13 
 
 
757 aa  194  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  27.81 
 
 
742 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  27.86 
 
 
759 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  27.12 
 
 
746 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  28.22 
 
 
783 aa  191  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.3 
 
 
742 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  25.68 
 
 
724 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  27.6 
 
 
746 aa  184  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  27.47 
 
 
746 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>