More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002470 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  100 
 
 
652 aa  1339    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  53.17 
 
 
663 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  54.42 
 
 
666 aa  719    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  68.1 
 
 
652 aa  943    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  57.94 
 
 
653 aa  780    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  52.68 
 
 
663 aa  695    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  54.42 
 
 
666 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  54.42 
 
 
666 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  54.57 
 
 
666 aa  720    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  54.27 
 
 
666 aa  715    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  44.61 
 
 
658 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  44.94 
 
 
665 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  44.13 
 
 
655 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  46.06 
 
 
665 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  46.06 
 
 
665 aa  538  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  45.9 
 
 
665 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  40.44 
 
 
740 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  42.68 
 
 
572 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.76 
 
 
656 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  38.27 
 
 
700 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 
713 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 
698 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  38.97 
 
 
676 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 
698 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 
698 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 
698 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.01 
 
 
696 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.01 
 
 
696 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.5 
 
 
695 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  36.88 
 
 
650 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  36.73 
 
 
650 aa  361  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  37.43 
 
 
656 aa  361  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 
726 aa  360  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  36.73 
 
 
650 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  36.73 
 
 
650 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 
715 aa  356  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  36.43 
 
 
650 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 
714 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  36.87 
 
 
659 aa  353  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  36.95 
 
 
663 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  36.95 
 
 
663 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  36.95 
 
 
663 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  36.95 
 
 
663 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 
702 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  36.95 
 
 
663 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  36.95 
 
 
641 aa  352  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  36.65 
 
 
663 aa  351  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  34.92 
 
 
680 aa  347  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 
743 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  37.14 
 
 
732 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  35.46 
 
 
664 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  30.87 
 
 
656 aa  310  5e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  34.3 
 
 
739 aa  310  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 
804 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 
799 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 
799 aa  290  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 
806 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 
681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  32.2 
 
 
653 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 
799 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  29.82 
 
 
704 aa  280  7e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 
649 aa  276  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.82 
 
 
635 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  30 
 
 
696 aa  268  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 
648 aa  266  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  29.36 
 
 
697 aa  266  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 
657 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  28.81 
 
 
702 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 
665 aa  263  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 
653 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 
662 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 
680 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 
662 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 
662 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
661 aa  258  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  29.36 
 
 
696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 
649 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  30.75 
 
 
640 aa  253  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 
649 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  29.78 
 
 
698 aa  253  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  28.73 
 
 
746 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  29.17 
 
 
742 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  28.96 
 
 
749 aa  231  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  29.22 
 
 
746 aa  231  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 
650 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  29.47 
 
 
703 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  28.28 
 
 
746 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  28.24 
 
 
746 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  28.24 
 
 
746 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  28.24 
 
 
746 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  29.74 
 
 
724 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  28.24 
 
 
746 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  26.55 
 
 
751 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  30.05 
 
 
724 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  26.55 
 
 
751 aa  224  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  29.53 
 
 
724 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  28.1 
 
 
746 aa  223  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  26.55 
 
 
751 aa  223  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  29.97 
 
 
724 aa  223  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  28.1 
 
 
746 aa  223  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>