More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1450 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  50.46 
 
 		 746 aa  705    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  50.33 
 
 		 746 aa  703    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  49.03 
 
 		 751 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  53.75 
 
 		 744 aa  713    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  50.46 
 
 		 746 aa  705    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  66.89 
 
 		 724 aa  999    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  54.46 
 
 		 744 aa  724    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  49.87 
 
 		 783 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  50 
 
 		 749 aa  670    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  52.84 
 
 		 757 aa  714    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  67.03 
 
 		 724 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  66.76 
 
 		 724 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  49.16 
 
 		 751 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  50.46 
 
 		 746 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  91.04 
 
 		 703 aa  1315    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  49.86 
 
 		 759 aa  690    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  49.16 
 
 		 751 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  50.2 
 
 		 746 aa  702    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  49.16 
 
 		 751 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  48.77 
 
 		 751 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  50.33 
 
 		 746 aa  705    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  67.03 
 
 		 724 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  100 
 
 		 740 aa  1513    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  50.59 
 
 		 746 aa  707    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  50.13 
 
 		 750 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  51.64 
 
 		 746 aa  741    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  52.56 
 
 		 746 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  50.59 
 
 		 746 aa  707    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  60.61 
 
 		 742 aa  870    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  54.03 
 
 		 744 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  50.2 
 
 		 746 aa  705    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  53.89 
 
 		 746 aa  728    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  66.76 
 
 		 724 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  51.01 
 
 		 766 aa  714    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  61.36 
 
 		 742 aa  879    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  52.51 
 
 		 746 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  42.39 
 
 		 777 aa  502  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 681 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 665 aa  313  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.3 
 
 		 659 aa  290  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  31.79 
 
 		 656 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.26 
 
 		 650 aa  286  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.26 
 
 		 650 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.26 
 
 		 650 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.26 
 
 		 650 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.12 
 
 		 650 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  31.63 
 
 		 641 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  31.36 
 
 		 663 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.27 
 
 		 663 aa  283  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  31.36 
 
 		 663 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 663 aa  282  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.36 
 
 		 663 aa  282  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.36 
 
 		 663 aa  282  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 653 aa  258  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 649 aa  251  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 635 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 662 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 653 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 662 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 649 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 680 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 662 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 661 aa  237  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 648 aa  234  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 657 aa  227  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  28.32 
 
 		 653 aa  227  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 649 aa  223  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  27.94 
 
 		 652 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.59 
 
 		 656 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 658 aa  217  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  28.02 
 
 		 665 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 698 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  28.32 
 
 		 640 aa  212  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  28.29 
 
 		 655 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 652 aa  208  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  28.96 
 
 		 666 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 740 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  28.76 
 
 		 666 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  29.09 
 
 		 666 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  29.09 
 
 		 666 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  29.1 
 
 		 663 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  29 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  26.61 
 
 		 700 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  27.93 
 
 		 680 aa  201  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  28.55 
 
 		 663 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  26.72 
 
 		 665 aa  197  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  26.72 
 
 		 665 aa  197  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  26.72 
 
 		 665 aa  197  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 702 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  26.83 
 
 		 732 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 726 aa  181  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.62 
 
 		 696 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.81 
 
 		 695 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.49 
 
 		 696 aa  178  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 714 aa  177  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 743 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 799 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>