More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4161 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  96.12 
 
 		 799 aa  1578    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 799 aa  1632    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  97.5 
 
 		 799 aa  1594    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 740 aa  350  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  32.73 
 
 		 663 aa  340  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.13 
 
 		 656 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  32.99 
 
 		 666 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  32.92 
 
 		 663 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  32.99 
 
 		 666 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  33.09 
 
 		 666 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  32.99 
 
 		 666 aa  334  5e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  32.99 
 
 		 666 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  34.08 
 
 		 653 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  33.88 
 
 		 665 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  33.24 
 
 		 700 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  33.33 
 
 		 655 aa  323  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 698 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 743 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 713 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  33.63 
 
 		 656 aa  320  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 658 aa  312  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  34.15 
 
 		 650 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.01 
 
 		 650 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  34.01 
 
 		 650 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  31.6 
 
 		 665 aa  310  6.999999999999999e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  31.6 
 
 		 665 aa  310  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  31.6 
 
 		 665 aa  310  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.67 
 
 		 650 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.82 
 
 		 650 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 663 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  33.48 
 
 		 663 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  33.82 
 
 		 659 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  33.87 
 
 		 641 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  33.48 
 
 		 663 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  33.72 
 
 		 663 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  33.48 
 
 		 663 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  33.48 
 
 		 663 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  31.59 
 
 		 652 aa  303  8.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 726 aa  297  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  33.13 
 
 		 676 aa  289  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 698 aa  287  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 698 aa  287  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 698 aa  287  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.19 
 
 		 696 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.19 
 
 		 696 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 702 aa  280  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.72 
 
 		 695 aa  277  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 714 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 652 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  29.48 
 
 		 702 aa  269  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1978  colicin I receptor  43.03 
 
 		 351 aa  266  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  30.15 
 
 		 656 aa  265  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 635 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  29.86 
 
 		 732 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  29.9 
 
 		 696 aa  260  7e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 681 aa  260  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 653 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 664 aa  256  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 804 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  35.76 
 
 		 572 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  29.85 
 
 		 680 aa  253  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 680 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 662 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 649 aa  244  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 665 aa  244  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 662 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 653 aa  242  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 662 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 715 aa  241  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 649 aa  241  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 661 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  28.83 
 
 		 696 aa  237  5.0000000000000005e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  29.53 
 
 		 739 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 649 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  44.53 
 
 		 326 aa  229  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  28.18 
 
 		 640 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 697 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 648 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  27.87 
 
 		 704 aa  216  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 657 aa  213  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 650 aa  202  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  28.48 
 
 		 742 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.59 
 
 		 742 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  27.76 
 
 		 724 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  27.76 
 
 		 724 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  27.76 
 
 		 724 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  27.54 
 
 		 724 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  27.54 
 
 		 724 aa  187  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  27.22 
 
 		 746 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  27.16 
 
 		 746 aa  180  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  26.82 
 
 		 703 aa  177  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  26.32 
 
 		 746 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  26.86 
 
 		 744 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  26.68 
 
 		 744 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  27.82 
 
 		 757 aa  167  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  26.65 
 
 		 744 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  25.33 
 
 		 740 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  27.2 
 
 		 766 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  27.45 
 
 		 746 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  36.19 
 
 		 806 aa  159  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>