More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4523 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  53.17 
 
 
652 aa  683    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  100 
 
 
663 aa  1361    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  89.04 
 
 
666 aa  1246    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  90.24 
 
 
666 aa  1253    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  53.13 
 
 
653 aa  719    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  88.89 
 
 
666 aa  1243    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  95.32 
 
 
663 aa  1306    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  88.89 
 
 
666 aa  1243    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  51.69 
 
 
652 aa  687    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  88.89 
 
 
666 aa  1244    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  48.49 
 
 
658 aa  616  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  45.17 
 
 
665 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  45.17 
 
 
665 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  45.17 
 
 
665 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  44.46 
 
 
665 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  43.05 
 
 
655 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  41.69 
 
 
740 aa  497  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  41.08 
 
 
656 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  43.98 
 
 
572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  38.5 
 
 
700 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  37.64 
 
 
713 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 
698 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 
726 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  37.57 
 
 
676 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 
743 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  35.92 
 
 
650 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  35.92 
 
 
650 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  36.07 
 
 
650 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  36.71 
 
 
659 aa  382  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  36.21 
 
 
663 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  36.21 
 
 
663 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  36.53 
 
 
656 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  36.21 
 
 
663 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  36.21 
 
 
663 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  36.21 
 
 
663 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  36.43 
 
 
641 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  36.21 
 
 
663 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  35.92 
 
 
650 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.63 
 
 
650 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  35.18 
 
 
656 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  36.24 
 
 
732 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 
664 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  34.49 
 
 
702 aa  360  7e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 
804 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 
698 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 
698 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 
698 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  34 
 
 
715 aa  357  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 
799 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  34.79 
 
 
680 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  32.95 
 
 
695 aa  339  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 
799 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 
799 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.56 
 
 
696 aa  334  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.56 
 
 
696 aa  334  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  33.23 
 
 
739 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 
806 aa  323  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 
714 aa  313  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  32.94 
 
 
653 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.69 
 
 
635 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  28.59 
 
 
704 aa  288  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 
661 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 
680 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  28.97 
 
 
697 aa  285  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 
662 aa  283  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 
662 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 
681 aa  280  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 
649 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 
649 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 
653 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  28.83 
 
 
696 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 
665 aa  273  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  29.2 
 
 
702 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 
649 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  28.75 
 
 
698 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 
662 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  28.83 
 
 
696 aa  271  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  31.43 
 
 
640 aa  267  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 
648 aa  230  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 
657 aa  228  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  29.57 
 
 
744 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  29.5 
 
 
744 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  27.67 
 
 
746 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  27.92 
 
 
746 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  28.84 
 
 
744 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  28.18 
 
 
746 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 
650 aa  208  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  27.73 
 
 
724 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  27.73 
 
 
724 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  27.87 
 
 
724 aa  203  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  27.87 
 
 
724 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  28.41 
 
 
703 aa  200  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  28.19 
 
 
724 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  28.55 
 
 
740 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  27.63 
 
 
749 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  28.41 
 
 
759 aa  194  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  26.64 
 
 
742 aa  194  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  27.28 
 
 
742 aa  193  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  27.91 
 
 
746 aa  193  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  27.77 
 
 
746 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>