More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1977 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  100 
 
 		 326 aa  676    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  44.53 
 
 		 799 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  43.43 
 
 		 799 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  43.43 
 
 		 799 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  42.86 
 
 		 653 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.07 
 
 		 656 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  38.7 
 
 		 655 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  37.18 
 
 		 740 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  40.75 
 
 		 700 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  40.33 
 
 		 713 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  40.07 
 
 		 652 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  37.42 
 
 		 698 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  43.93 
 
 		 658 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  41.53 
 
 		 666 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  41.53 
 
 		 666 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  41.53 
 
 		 666 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  41.53 
 
 		 666 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  34.98 
 
 		 665 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  34.98 
 
 		 665 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  40.85 
 
 		 666 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  34.98 
 
 		 665 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  39.25 
 
 		 665 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  38.19 
 
 		 663 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  40.43 
 
 		 663 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  39.42 
 
 		 676 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  39.85 
 
 		 726 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  40.52 
 
 		 656 aa  170  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  38.25 
 
 		 702 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 652 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  35.97 
 
 		 732 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  36.93 
 
 		 656 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  42.61 
 
 		 680 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  48.39 
 
 		 714 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 715 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 698 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 698 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 698 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  34.18 
 
 		 650 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  34.18 
 
 		 650 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  34.18 
 
 		 650 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.18 
 
 		 650 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  44.66 
 
 		 695 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  36.61 
 
 		 696 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  36.61 
 
 		 696 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.97 
 
 		 650 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  41.51 
 
 		 806 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  39.43 
 
 		 743 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.08 
 
 		 663 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 663 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.08 
 
 		 659 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.08 
 
 		 663 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.08 
 
 		 663 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.08 
 
 		 663 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  41.83 
 
 		 663 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 665 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  43.62 
 
 		 641 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  39.6 
 
 		 696 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  38.57 
 
 		 739 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  34.04 
 
 		 698 aa  147  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  40 
 
 		 702 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  42.08 
 
 		 704 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  40.87 
 
 		 697 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  36.44 
 
 		 696 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 804 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  37.75 
 
 		 664 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  43.81 
 
 		 681 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  33.06 
 
 		 572 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  42.61 
 
 		 649 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 650 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 653 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  36.63 
 
 		 635 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  28.44 
 
 		 724 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  40.27 
 
 		 640 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  28.44 
 
 		 724 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  28.44 
 
 		 724 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  28.44 
 
 		 724 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 649 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 649 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 662 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  42.07 
 
 		 706 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 661 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 662 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 657 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 662 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 648 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 653 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  27.84 
 
 		 724 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 680 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  35.93 
 
 		 628 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  29.13 
 
 		 742 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  40.27 
 
 		 699 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.64 
 
 		 619 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  29.34 
 
 		 742 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  42.55 
 
 		 1023 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.89 
 
 		 614 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  36.17 
 
 		 759 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  32.43 
 
 		 746 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.89 
 
 		 614 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  32.41 
 
 		 740 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.27 
 
 		 614 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>