More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01120 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  100 
 
 		 572 aa  1174    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  50.18 
 
 		 653 aa  535  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  44.15 
 
 		 666 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  44.15 
 
 		 663 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  44.17 
 
 		 666 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  44.17 
 
 		 666 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  43.98 
 
 		 663 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  44.17 
 
 		 666 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  42.96 
 
 		 652 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  44 
 
 		 666 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  42.68 
 
 		 652 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  40 
 
 		 665 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  39.83 
 
 		 665 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  40 
 
 		 665 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  39.72 
 
 		 665 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  38.56 
 
 		 655 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.75 
 
 		 656 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 658 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 740 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  33.39 
 
 		 743 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 698 aa  320  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  36.36 
 
 		 676 aa  317  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 713 aa  310  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  34.34 
 
 		 700 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  33.45 
 
 		 696 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 698 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 698 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  33.45 
 
 		 696 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 698 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 726 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 702 aa  289  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 715 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.61 
 
 		 650 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  33.44 
 
 		 650 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  33 
 
 		 659 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.05 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  33.44 
 
 		 650 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 663 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.78 
 
 		 663 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  31.94 
 
 		 656 aa  274  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.78 
 
 		 663 aa  274  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.78 
 
 		 663 aa  274  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  33.39 
 
 		 695 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.28 
 
 		 650 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  32.61 
 
 		 641 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.28 
 
 		 650 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.61 
 
 		 663 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.61 
 
 		 663 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  30.51 
 
 		 732 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 714 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 799 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 799 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 799 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  31.83 
 
 		 696 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 664 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  31.27 
 
 		 702 aa  243  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  30.69 
 
 		 698 aa  232  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  31.42 
 
 		 704 aa  233  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 697 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  31.12 
 
 		 680 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  31.22 
 
 		 696 aa  226  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 665 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 681 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 649 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  29.35 
 
 		 739 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 635 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 662 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 653 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 662 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 662 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 680 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 649 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 649 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 653 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 661 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 804 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 648 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 657 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  29.03 
 
 		 640 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 650 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  27.52 
 
 		 749 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  26.71 
 
 		 759 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  28.06 
 
 		 703 aa  158  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  30.89 
 
 		 746 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  26.85 
 
 		 746 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  26.8 
 
 		 746 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.11 
 
 		 742 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  27.78 
 
 		 742 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  29.8 
 
 		 744 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  27.15 
 
 		 740 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  29.61 
 
 		 744 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 806 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  29.61 
 
 		 744 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  27.44 
 
 		 766 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  26.95 
 
 		 777 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1811  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  32 
 
 		 330 aa  144  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  26.86 
 
 		 746 aa  144  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  26.86 
 
 		 746 aa  144  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  26.86 
 
 		 746 aa  144  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  26.86 
 
 		 746 aa  144  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>