More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4579 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  56.52 
 
 
746 aa  797    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  56.39 
 
 
746 aa  796    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  55.25 
 
 
751 aa  774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  55.25 
 
 
751 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  60.83 
 
 
724 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  54.62 
 
 
744 aa  763    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  60.83 
 
 
724 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  54.04 
 
 
746 aa  748    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  55.2 
 
 
746 aa  761    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  57.02 
 
 
766 aa  791    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  56.66 
 
 
746 aa  799    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  59.02 
 
 
746 aa  838    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  56.79 
 
 
746 aa  800    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  55.39 
 
 
751 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  59.13 
 
 
740 aa  879    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  54.97 
 
 
783 aa  748    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  56.66 
 
 
746 aa  798    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  54.05 
 
 
749 aa  706    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  55.39 
 
 
751 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  54.98 
 
 
751 aa  771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  56.52 
 
 
746 aa  797    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  56.24 
 
 
744 aa  758    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  56.66 
 
 
746 aa  800    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  55.54 
 
 
750 aa  768    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  100 
 
 
742 aa  1512    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  61.03 
 
 
746 aa  843    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  54.36 
 
 
744 aa  763    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  95.96 
 
 
742 aa  1440    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  60.91 
 
 
724 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  56.79 
 
 
746 aa  800    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  61.06 
 
 
724 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  52.88 
 
 
759 aa  793    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  56.52 
 
 
746 aa  798    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  62.87 
 
 
703 aa  888    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  61.06 
 
 
724 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  53.8 
 
 
757 aa  759    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  44.54 
 
 
777 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  34.7 
 
 
659 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  34.6 
 
 
663 aa  324  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  34.6 
 
 
663 aa  324  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 
663 aa  323  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 
665 aa  323  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  34.6 
 
 
663 aa  323  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  34.6 
 
 
663 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  34.6 
 
 
663 aa  323  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  34.06 
 
 
641 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 
681 aa  320  7e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.77 
 
 
656 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  34.12 
 
 
650 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.12 
 
 
650 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  34.26 
 
 
650 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.98 
 
 
650 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  34.12 
 
 
650 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  32.47 
 
 
653 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.86 
 
 
635 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  30.11 
 
 
652 aa  254  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  30.78 
 
 
653 aa  250  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 
658 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.2 
 
 
656 aa  234  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  28.69 
 
 
665 aa  227  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  28.69 
 
 
665 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  28.69 
 
 
665 aa  226  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
649 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
649 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  30.21 
 
 
665 aa  223  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 
648 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
653 aa  217  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 
698 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
662 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 
657 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 
680 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  28.51 
 
 
655 aa  212  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 
662 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 
662 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 
661 aa  210  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 
652 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  28.02 
 
 
640 aa  208  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 
649 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  27.15 
 
 
663 aa  205  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  27.49 
 
 
666 aa  204  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  27.81 
 
 
666 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  27.81 
 
 
666 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  27.81 
 
 
666 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  27.81 
 
 
666 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  29.19 
 
 
680 aa  200  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  27.42 
 
 
663 aa  197  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
799 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 
740 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.92 
 
 
695 aa  190  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 
799 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 
650 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
799 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 
726 aa  188  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  28.3 
 
 
700 aa  188  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.74 
 
 
696 aa  184  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.74 
 
 
696 aa  184  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 
743 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>