More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00539 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  100 
 
 
746 aa  1534    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  99.87 
 
 
746 aa  1533    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  56.93 
 
 
742 aa  796    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  48.37 
 
 
744 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  81.85 
 
 
751 aa  1269    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  52.06 
 
 
724 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  99.87 
 
 
746 aa  1533    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  52.06 
 
 
724 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  51.93 
 
 
724 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  81.59 
 
 
751 aa  1268    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  65.84 
 
 
783 aa  962    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  60.42 
 
 
746 aa  896    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  99.46 
 
 
746 aa  1529    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  99.33 
 
 
746 aa  1526    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  50.34 
 
 
703 aa  694    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  99.33 
 
 
746 aa  1527    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  52.01 
 
 
724 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  64.97 
 
 
766 aa  946    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  81.32 
 
 
751 aa  1265    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  80.47 
 
 
750 aa  1236    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  81.99 
 
 
751 aa  1271    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  50.46 
 
 
740 aa  705    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  61.11 
 
 
746 aa  897    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  56.4 
 
 
742 aa  789    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  52.14 
 
 
724 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  100 
 
 
746 aa  1534    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  69.63 
 
 
759 aa  1073    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  48.64 
 
 
746 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  49.31 
 
 
746 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  99.33 
 
 
746 aa  1526    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  81.85 
 
 
751 aa  1270    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  49.72 
 
 
757 aa  679    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  99.73 
 
 
746 aa  1530    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  47.91 
 
 
744 aa  635  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  47.7 
 
 
744 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  47.63 
 
 
749 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  39.15 
 
 
777 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 
665 aa  289  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 
681 aa  283  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.84 
 
 
656 aa  278  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.61 
 
 
659 aa  273  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.19 
 
 
650 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.19 
 
 
650 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.19 
 
 
650 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.19 
 
 
650 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.05 
 
 
650 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.44 
 
 
663 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.44 
 
 
663 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  32.44 
 
 
641 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 
663 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.44 
 
 
663 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.44 
 
 
663 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.87 
 
 
663 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  29.54 
 
 
653 aa  241  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  28.19 
 
 
652 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  30.52 
 
 
665 aa  230  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  30.52 
 
 
665 aa  230  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  30.52 
 
 
665 aa  230  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.79 
 
 
656 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  29.36 
 
 
653 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 
648 aa  221  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  29.06 
 
 
635 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  30.36 
 
 
665 aa  219  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 
657 aa  217  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
652 aa  210  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
658 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  27.47 
 
 
655 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  28.29 
 
 
666 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
698 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
698 aa  201  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
698 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 
714 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 
702 aa  200  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  27.89 
 
 
666 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  28.43 
 
 
666 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  28.43 
 
 
666 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  28.43 
 
 
666 aa  197  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  27.75 
 
 
663 aa  194  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.25 
 
 
696 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  27.76 
 
 
695 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.25 
 
 
696 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  27.63 
 
 
663 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.62 
 
 
640 aa  183  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 
649 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 
740 aa  181  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  26.99 
 
 
700 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 
662 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 
680 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 
726 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  26.49 
 
 
680 aa  170  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 
662 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
662 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 
732 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
661 aa  167  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 
649 aa  167  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
653 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 
698 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 
650 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  26.6 
 
 
676 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 
649 aa  160  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>