More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3964 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  60.42 
 
 
746 aa  900    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  60.42 
 
 
746 aa  900    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  52.58 
 
 
744 aa  713    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  51.04 
 
 
744 aa  720    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  51.94 
 
 
724 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  61.36 
 
 
759 aa  912    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  50.86 
 
 
757 aa  724    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  52.08 
 
 
724 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  100 
 
 
746 aa  1531    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  61.23 
 
 
751 aa  931    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  60.28 
 
 
746 aa  897    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  51.64 
 
 
740 aa  748    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  51.81 
 
 
724 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  60.56 
 
 
746 aa  900    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  52.22 
 
 
724 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  61.1 
 
 
751 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  60.69 
 
 
746 aa  901    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  60.42 
 
 
746 aa  900    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  60.42 
 
 
746 aa  900    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  50.72 
 
 
744 aa  711    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  51.81 
 
 
724 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  62.83 
 
 
751 aa  930    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  51.17 
 
 
749 aa  677    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  62.97 
 
 
751 aa  931    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  60.42 
 
 
746 aa  900    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  59.04 
 
 
742 aa  842    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  60.69 
 
 
746 aa  903    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  97.86 
 
 
746 aa  1500    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  60.42 
 
 
742 aa  837    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  60.83 
 
 
751 aa  926    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  51.54 
 
 
746 aa  711    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  53.96 
 
 
703 aa  750    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  65.59 
 
 
766 aa  942    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  59.95 
 
 
750 aa  888    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  61.41 
 
 
783 aa  910    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  50.26 
 
 
746 aa  711    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  39.77 
 
 
777 aa  498  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  33.29 
 
 
659 aa  307  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.33 
 
 
663 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.33 
 
 
663 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 
663 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.33 
 
 
663 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.33 
 
 
663 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.33 
 
 
663 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 
681 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  32.43 
 
 
641 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.63 
 
 
650 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.63 
 
 
650 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.49 
 
 
650 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 
665 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.63 
 
 
650 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.81 
 
 
656 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.49 
 
 
650 aa  293  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  31.77 
 
 
653 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  31.59 
 
 
635 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  28.95 
 
 
652 aa  243  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  28.51 
 
 
653 aa  231  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 
648 aa  229  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
658 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 
652 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  29.96 
 
 
665 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.04 
 
 
656 aa  224  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  28.4 
 
 
666 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  28.4 
 
 
666 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  28.4 
 
 
666 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  28.27 
 
 
666 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  27.82 
 
 
663 aa  219  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  27.8 
 
 
666 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 
657 aa  217  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  27.92 
 
 
663 aa  213  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 
740 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  28.7 
 
 
665 aa  205  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  28.7 
 
 
665 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 
649 aa  206  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  28.7 
 
 
665 aa  206  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.34 
 
 
640 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  27.65 
 
 
700 aa  200  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  27.44 
 
 
680 aa  200  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 
698 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
698 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
698 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
698 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 
649 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  27.07 
 
 
655 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 
653 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
662 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
680 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  27 
 
 
661 aa  195  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 
649 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
662 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 
662 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 
702 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 
732 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
714 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 
804 aa  184  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 
726 aa  184  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
799 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  27.25 
 
 
696 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  27.25 
 
 
696 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
743 aa  179  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>