More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3290 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  98.79 
 
 
663 aa  1343    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  98.94 
 
 
663 aa  1345    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  87.85 
 
 
650 aa  1199    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  98.79 
 
 
663 aa  1342    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  87.54 
 
 
650 aa  1196    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  87.54 
 
 
650 aa  1197    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  98.94 
 
 
663 aa  1345    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  98.94 
 
 
663 aa  1345    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  100 
 
 
659 aa  1358    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  82.09 
 
 
656 aa  1135    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  98.44 
 
 
641 aa  1288    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  98.79 
 
 
663 aa  1343    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  87.69 
 
 
650 aa  1198    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  88 
 
 
650 aa  1201    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  36.23 
 
 
653 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  37.63 
 
 
666 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  37.31 
 
 
653 aa  399  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  37.81 
 
 
666 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  36.68 
 
 
635 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  38.05 
 
 
666 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  37.52 
 
 
666 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  38.05 
 
 
666 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  38.45 
 
 
665 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  38.3 
 
 
665 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  38.45 
 
 
665 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  37.03 
 
 
663 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  36.71 
 
 
663 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  35.22 
 
 
665 aa  379  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  36.43 
 
 
652 aa  363  6e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 
740 aa  359  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.75 
 
 
656 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 
658 aa  353  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 
649 aa  350  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 
657 aa  349  9e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  37.16 
 
 
648 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 
743 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 
726 aa  343  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  33.19 
 
 
655 aa  341  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  36.87 
 
 
652 aa  341  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 
661 aa  339  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 
681 aa  339  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 
665 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 
653 aa  333  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  34.66 
 
 
640 aa  332  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 
649 aa  330  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  34.96 
 
 
742 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 
649 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 
662 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  34.72 
 
 
742 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 
662 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  34.39 
 
 
724 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 
680 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  34.25 
 
 
724 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 
702 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  34.11 
 
 
724 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  33.98 
 
 
724 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 
662 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  33.47 
 
 
724 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  33.77 
 
 
700 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  31.99 
 
 
732 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 
698 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
698 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
698 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
698 aa  310  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 
799 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 
714 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  33.2 
 
 
746 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 
799 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  32.9 
 
 
746 aa  302  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 
799 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 
650 aa  296  8e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  32.19 
 
 
746 aa  290  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  31.64 
 
 
703 aa  290  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  31.3 
 
 
740 aa  290  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.88 
 
 
695 aa  287  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  32.19 
 
 
696 aa  284  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 
806 aa  284  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  32.45 
 
 
696 aa  283  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  31.8 
 
 
757 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  31.02 
 
 
746 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  31.42 
 
 
744 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 
676 aa  280  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  31.1 
 
 
744 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  33.43 
 
 
680 aa  277  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  33 
 
 
572 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  31.28 
 
 
744 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  32.11 
 
 
751 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  32.61 
 
 
746 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  32.48 
 
 
746 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 
713 aa  273  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  32.48 
 
 
746 aa  273  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  32.61 
 
 
746 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  32.61 
 
 
746 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  32.48 
 
 
746 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  31.98 
 
 
751 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  31.9 
 
 
746 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  31.98 
 
 
751 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  31.98 
 
 
751 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  32.35 
 
 
746 aa  273  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 
746 aa  272  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>