More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01404 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1313    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  44.63 
 
 		 661 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  44.91 
 
 		 653 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  44.46 
 
 		 649 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  44.98 
 
 		 662 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  44.66 
 
 		 662 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  43.91 
 
 		 649 aa  528  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  44.82 
 
 		 662 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  44.31 
 
 		 680 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  41.85 
 
 		 648 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  41.76 
 
 		 657 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 649 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  34.66 
 
 		 659 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.59 
 
 		 656 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 663 aa  330  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  34.31 
 
 		 663 aa  330  7e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  34.31 
 
 		 663 aa  330  7e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  34.31 
 
 		 663 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  34.31 
 
 		 663 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  34.67 
 
 		 650 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  34.67 
 
 		 650 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.67 
 
 		 650 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  34.67 
 
 		 650 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  34.16 
 
 		 663 aa  328  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  34.51 
 
 		 650 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  34.46 
 
 		 641 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 653 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 635 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 650 aa  289  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 740 aa  273  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.96 
 
 		 656 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  31.56 
 
 		 666 aa  269  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  30.79 
 
 		 655 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  31.43 
 
 		 663 aa  267  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 681 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  31.07 
 
 		 663 aa  264  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  30.45 
 
 		 666 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  30.75 
 
 		 666 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  30.75 
 
 		 666 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  30.75 
 
 		 666 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  31.25 
 
 		 652 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  31.85 
 
 		 653 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  31.43 
 
 		 665 aa  249  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  31.43 
 
 		 665 aa  249  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  31.43 
 
 		 665 aa  249  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  30.38 
 
 		 676 aa  247  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 698 aa  247  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 702 aa  243  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 713 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  29.38 
 
 		 700 aa  234  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 698 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 698 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 698 aa  231  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  30.13 
 
 		 665 aa  230  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  30.58 
 
 		 680 aa  230  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.57 
 
 		 695 aa  229  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 714 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 665 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 658 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  30.48 
 
 		 633 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 799 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  29.91 
 
 		 656 aa  218  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 743 aa  217  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  29.72 
 
 		 732 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  29.58 
 
 		 696 aa  216  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 799 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  29.58 
 
 		 696 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  28.34 
 
 		 746 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  28.32 
 
 		 740 aa  212  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 799 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  27.49 
 
 		 696 aa  210  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  27.45 
 
 		 696 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 726 aa  207  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  27.89 
 
 		 742 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  27.84 
 
 		 703 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  27.93 
 
 		 744 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  28.38 
 
 		 744 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  28.05 
 
 		 744 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.03 
 
 		 742 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  26.98 
 
 		 698 aa  205  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  28.48 
 
 		 739 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 613 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  26.34 
 
 		 746 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  26.44 
 
 		 702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  27.49 
 
 		 766 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 715 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  26.47 
 
 		 746 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  27.96 
 
 		 757 aa  198  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  27.61 
 
 		 783 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  27.39 
 
 		 746 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  29.34 
 
 		 724 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  29.34 
 
 		 724 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  29.1 
 
 		 724 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  28.51 
 
 		 724 aa  193  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 634 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  28.82 
 
 		 724 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  27.15 
 
 		 759 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  26.34 
 
 		 751 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  26.4 
 
 		 751 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>