More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0852 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  100 
 
 		 633 aa  1307    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 634 aa  356  8.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  35.45 
 
 		 639 aa  341  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 613 aa  247  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  30.48 
 
 		 640 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  28.84 
 
 		 656 aa  211  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  28.55 
 
 		 663 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 663 aa  208  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  28.4 
 
 		 663 aa  208  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  28.4 
 
 		 663 aa  208  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  28.4 
 
 		 663 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  28.4 
 
 		 663 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  27.98 
 
 		 659 aa  205  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  28.3 
 
 		 641 aa  204  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  30.1 
 
 		 650 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 650 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  29.57 
 
 		 650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  29.93 
 
 		 650 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  29.93 
 
 		 650 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  29.93 
 
 		 650 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 699 aa  198  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 657 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 649 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 635 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 653 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 706 aa  188  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 642 aa  183  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 648 aa  180  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 680 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 662 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 662 aa  177  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 649 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 653 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  27.23 
 
 		 663 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 743 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 649 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 662 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  27.59 
 
 		 666 aa  170  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 698 aa  170  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 634 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 661 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  27.74 
 
 		 666 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  27.68 
 
 		 666 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  27.2 
 
 		 656 aa  167  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  27.68 
 
 		 666 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 698 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 698 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 698 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  27.53 
 
 		 666 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.95 
 
 		 646 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 702 aa  163  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  26.7 
 
 		 663 aa  160  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.77 
 
 		 656 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  25.95 
 
 		 655 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 614 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.54 
 
 		 653 aa  158  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 726 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 627 aa  158  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 676 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1128 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  27.2 
 
 		 704 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 619 aa  154  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 616 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.12 
 
 		 631 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.17 
 
 		 1023 aa  152  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  26.14 
 
 		 700 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 665 aa  150  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.37 
 
 		 618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 694 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 634 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 628 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  26.63 
 
 		 668 aa  144  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 628 aa  143  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.94 
 
 		 623 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  24.54 
 
 		 777 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 681 aa  142  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  26.95 
 
 		 680 aa  141  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 740 aa  140  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  23.64 
 
 		 646 aa  139  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 602 aa  139  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  26.01 
 
 		 746 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 617 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.17 
 
 		 615 aa  138  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  26.88 
 
 		 653 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  26.29 
 
 		 746 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  26.29 
 
 		 746 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.49 
 
 		 645 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 624 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 746 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.13 
 
 		 613 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  27.94 
 
 		 739 aa  135  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 713 aa  135  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 647 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  24.61 
 
 		 744 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25 
 
 		 697 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 799 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  24.63 
 
 		 622 aa  134  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 		 620 aa  134  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>