More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3496 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  87.53 
 
 		 746 aa  1360    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  97.85 
 
 		 744 aa  1493    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  55.67 
 
 		 742 aa  755    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  51.4 
 
 		 746 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  51.93 
 
 		 724 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  100 
 
 		 744 aa  1523    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  52.43 
 
 		 749 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  52.07 
 
 		 724 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  52.07 
 
 		 724 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  47.7 
 
 		 746 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  50.72 
 
 		 746 aa  706    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  51.12 
 
 		 746 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  54.94 
 
 		 742 aa  754    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  52.07 
 
 		 724 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  52.07 
 
 		 724 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  97.04 
 
 		 744 aa  1456    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  47.51 
 
 		 766 aa  652    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  54.03 
 
 		 740 aa  717    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  45.8 
 
 		 759 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  49.34 
 
 		 757 aa  658    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  47.7 
 
 		 746 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  55.75 
 
 		 703 aa  736    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  47.7 
 
 		 746 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  47.7 
 
 		 746 aa  633  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  47.7 
 
 		 746 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  49.03 
 
 		 783 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  47.7 
 
 		 746 aa  635  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  47.7 
 
 		 746 aa  633  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  47.7 
 
 		 746 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  47.36 
 
 		 746 aa  631  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  47.66 
 
 		 751 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  48.08 
 
 		 751 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  48.08 
 
 		 751 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  48.08 
 
 		 751 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  48.08 
 
 		 751 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  46.96 
 
 		 750 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  38.33 
 
 		 777 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 665 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 681 aa  286  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.63 
 
 		 650 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.63 
 
 		 650 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.63 
 
 		 650 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.28 
 
 		 659 aa  275  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.63 
 
 		 650 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  31.56 
 
 		 641 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.34 
 
 		 650 aa  273  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  31.56 
 
 		 663 aa  273  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 663 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  31.56 
 
 		 663 aa  273  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.56 
 
 		 663 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.56 
 
 		 663 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.28 
 
 		 663 aa  272  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  30.29 
 
 		 656 aa  268  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 653 aa  251  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 635 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 648 aa  243  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  29.75 
 
 		 653 aa  237  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  28.79 
 
 		 655 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 657 aa  233  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 649 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 649 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 649 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 702 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 662 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 653 aa  223  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.74 
 
 		 656 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 662 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 740 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  28.53 
 
 		 665 aa  222  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 662 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 661 aa  221  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  27.88 
 
 		 652 aa  221  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  29.49 
 
 		 663 aa  220  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 680 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  29.5 
 
 		 663 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 698 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  29.19 
 
 		 666 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  29.23 
 
 		 666 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  29.08 
 
 		 666 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  29.23 
 
 		 666 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  29.09 
 
 		 666 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  26.91 
 
 		 665 aa  208  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.17 
 
 		 695 aa  207  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  26.91 
 
 		 665 aa  207  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  26.91 
 
 		 665 aa  207  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 650 aa  205  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  28.38 
 
 		 640 aa  205  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 652 aa  204  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 658 aa  203  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  28.26 
 
 		 700 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  29.5 
 
 		 696 aa  196  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  29.33 
 
 		 680 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  29.5 
 
 		 696 aa  196  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 743 aa  194  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 698 aa  193  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 698 aa  193  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 698 aa  193  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 713 aa  193  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 714 aa  190  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  26.51 
 
 		 732 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>