More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3276 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  49.58 
 
 		 743 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 698 aa  1418    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  56.27 
 
 		 696 aa  775    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  55.57 
 
 		 695 aa  790    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  58.91 
 
 		 714 aa  805    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 698 aa  1418    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  71.49 
 
 		 702 aa  1026    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 698 aa  1418    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  56.12 
 
 		 696 aa  773    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  45.17 
 
 		 726 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  36.99 
 
 		 806 aa  452  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 804 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  36.52 
 
 		 702 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  36.62 
 
 		 696 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  38.05 
 
 		 698 aa  410  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  33.47 
 
 		 696 aa  384  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  34.49 
 
 		 666 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  34.35 
 
 		 666 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  34.26 
 
 		 666 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  34.58 
 
 		 653 aa  372  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  34.35 
 
 		 666 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 		 652 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  33.94 
 
 		 663 aa  363  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  33.66 
 
 		 666 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  35.79 
 
 		 665 aa  359  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  35.29 
 
 		 665 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  33.29 
 
 		 663 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  35.29 
 
 		 665 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  35.29 
 
 		 665 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  34.36 
 
 		 652 aa  358  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 713 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  34.71 
 
 		 700 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  34.18 
 
 		 655 aa  351  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.22 
 
 		 656 aa  343  8e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 740 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 698 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 658 aa  325  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.92 
 
 		 656 aa  314  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  33.38 
 
 		 663 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  33.43 
 
 		 659 aa  310  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  33.38 
 
 		 663 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  33.38 
 
 		 663 aa  310  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  33.38 
 
 		 663 aa  310  8e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  33.38 
 
 		 663 aa  310  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  33.09 
 
 		 663 aa  310  9e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.87 
 
 		 650 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.87 
 
 		 650 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.87 
 
 		 650 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.72 
 
 		 650 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.72 
 
 		 650 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  33.28 
 
 		 641 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  31.77 
 
 		 704 aa  303  9e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  32.67 
 
 		 680 aa  300  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  33.27 
 
 		 572 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  33.48 
 
 		 732 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 697 aa  290  4e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 648 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 799 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 799 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 681 aa  287  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 799 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 715 aa  286  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  32.65 
 
 		 676 aa  278  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 657 aa  276  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  28.55 
 
 		 656 aa  268  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  31 
 
 		 653 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 649 aa  264  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 662 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 662 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 649 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  29.32 
 
 		 739 aa  261  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 653 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 662 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 635 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 680 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 665 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 661 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 649 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  30.2 
 
 		 640 aa  231  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  28.32 
 
 		 746 aa  204  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  28.57 
 
 		 750 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  28.06 
 
 		 746 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  28.13 
 
 		 746 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  28.19 
 
 		 746 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  28.19 
 
 		 746 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  28.19 
 
 		 746 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  28.19 
 
 		 746 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 746 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  28.06 
 
 		 746 aa  201  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  27.23 
 
 		 746 aa  197  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  27.25 
 
 		 746 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  27.07 
 
 		 744 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  29.45 
 
 		 759 aa  194  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  27.07 
 
 		 744 aa  194  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  27.4 
 
 		 744 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  27.55 
 
 		 746 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  28.45 
 
 		 746 aa  189  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  27.79 
 
 		 751 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  27.77 
 
 		 766 aa  188  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>