More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3220 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  65.13 
 
 		 665 aa  902    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  50.53 
 
 		 655 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  65.13 
 
 		 665 aa  902    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  100 
 
 		 665 aa  1379    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  64.98 
 
 		 665 aa  901    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  47.31 
 
 		 653 aa  615  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  46.05 
 
 		 652 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  45.06 
 
 		 666 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  44.56 
 
 		 666 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  44.46 
 
 		 663 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  45.09 
 
 		 666 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  44.61 
 
 		 666 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  44.61 
 
 		 666 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  44.58 
 
 		 663 aa  557  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  44.94 
 
 		 652 aa  535  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  42.03 
 
 		 658 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  42.31 
 
 		 676 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  42.96 
 
 		 740 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  37.76 
 
 		 700 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  37.24 
 
 		 715 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.52 
 
 		 656 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  39.72 
 
 		 572 aa  412  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 743 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  36.27 
 
 		 664 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  36.86 
 
 		 698 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 726 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  37.12 
 
 		 732 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  36.51 
 
 		 656 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  35.87 
 
 		 650 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.72 
 
 		 650 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  34.88 
 
 		 663 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  34.88 
 
 		 663 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  35.72 
 
 		 650 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  35.22 
 
 		 659 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  35.62 
 
 		 650 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  35.58 
 
 		 650 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 		 663 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  35.37 
 
 		 641 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  34.88 
 
 		 663 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  34.88 
 
 		 663 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  34.88 
 
 		 663 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  36.38 
 
 		 680 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 713 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 702 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.76 
 
 		 696 aa  360  5e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 698 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 698 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 698 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.62 
 
 		 696 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 656 aa  356  7.999999999999999e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.55 
 
 		 695 aa  352  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 714 aa  334  4e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 804 aa  330  7e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 799 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 799 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  32.25 
 
 		 739 aa  319  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 799 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  34.61 
 
 		 681 aa  306  8.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 653 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 635 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  30.72 
 
 		 696 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 665 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 648 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  31.29 
 
 		 702 aa  273  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 657 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  30.36 
 
 		 696 aa  264  3e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  29.91 
 
 		 704 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  30.24 
 
 		 698 aa  263  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 697 aa  259  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 649 aa  251  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 649 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 649 aa  234  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  30.13 
 
 		 640 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 662 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 653 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  28.96 
 
 		 744 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 662 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 662 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 680 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  29.05 
 
 		 724 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  29.14 
 
 		 724 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 661 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  29.14 
 
 		 724 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  29.96 
 
 		 746 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  29.05 
 
 		 724 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  30.35 
 
 		 742 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  28.49 
 
 		 703 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  29.22 
 
 		 724 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  28.53 
 
 		 744 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  29.96 
 
 		 746 aa  220  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  27.98 
 
 		 746 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  30.36 
 
 		 746 aa  219  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  30.36 
 
 		 746 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  30.36 
 
 		 746 aa  219  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  30.36 
 
 		 746 aa  219  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 746 aa  218  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  29.76 
 
 		 759 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  29.86 
 
 		 742 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  28.1 
 
 		 744 aa  217  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  28.02 
 
 		 740 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>