More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3364 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 
635 aa  1285    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  95.12 
 
 
653 aa  1232    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  40.78 
 
 
650 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  36.76 
 
 
663 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  36.76 
 
 
663 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  36.76 
 
 
663 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  36.76 
 
 
663 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  36.76 
 
 
663 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  36.76 
 
 
663 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  36.68 
 
 
659 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  36.97 
 
 
641 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  37.22 
 
 
656 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  36.73 
 
 
650 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  36.58 
 
 
650 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  36.28 
 
 
650 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  36.58 
 
 
650 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  36.58 
 
 
650 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 
649 aa  333  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 
648 aa  326  9e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 
657 aa  318  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 
681 aa  316  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  32.22 
 
 
640 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  33.95 
 
 
653 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  33.53 
 
 
665 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.64 
 
 
656 aa  300  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 
661 aa  299  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  32.49 
 
 
666 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  32.49 
 
 
666 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  33.14 
 
 
666 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  32.39 
 
 
666 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  32.49 
 
 
666 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 
740 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 
653 aa  293  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 
658 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  31.91 
 
 
655 aa  291  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  32.69 
 
 
663 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 
649 aa  291  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  33.33 
 
 
663 aa  287  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 
743 aa  287  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 
665 aa  286  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 
662 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 
680 aa  286  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 
662 aa  286  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 
662 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 
649 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  32.81 
 
 
665 aa  277  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  32.81 
 
 
665 aa  277  6e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  32.65 
 
 
665 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  30.86 
 
 
652 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 
702 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  32.86 
 
 
742 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 
652 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  32.31 
 
 
742 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 
714 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 
799 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 
799 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 
726 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.53 
 
 
695 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 
799 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 
698 aa  262  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 
698 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 
698 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 
698 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.84 
 
 
696 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.05 
 
 
696 aa  258  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  29.82 
 
 
703 aa  253  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  32.1 
 
 
746 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  31.55 
 
 
732 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  31.86 
 
 
746 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  31.43 
 
 
744 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  29.23 
 
 
740 aa  250  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 
713 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  30.88 
 
 
744 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  31.44 
 
 
746 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  30.74 
 
 
744 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 
804 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  29.78 
 
 
696 aa  239  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  31.17 
 
 
700 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  30.28 
 
 
702 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  28.96 
 
 
696 aa  238  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  30 
 
 
664 aa  236  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  30.15 
 
 
724 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  30.01 
 
 
724 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  30.15 
 
 
724 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  30.01 
 
 
724 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  29.87 
 
 
724 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  30.01 
 
 
680 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  29.66 
 
 
698 aa  231  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  33.54 
 
 
739 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  28.85 
 
 
750 aa  226  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  28.89 
 
 
751 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  29.22 
 
 
757 aa  223  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0385  TonB-dependent receptor, plug  30.82 
 
 
713 aa  223  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  28.89 
 
 
751 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  29.34 
 
 
746 aa  223  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  28.89 
 
 
751 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  29.34 
 
 
746 aa  223  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  29.2 
 
 
746 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  29.28 
 
 
746 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  28.45 
 
 
746 aa  223  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>