More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0638 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  81.32 
 
 		 746 aa  1265    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  81.19 
 
 		 746 aa  1264    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  50.33 
 
 		 724 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  50.2 
 
 		 724 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  63.66 
 
 		 766 aa  934    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  64.35 
 
 		 783 aa  962    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  81.32 
 
 		 746 aa  1265    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  50.33 
 
 		 724 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  100 
 
 		 751 aa  1545    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  99.6 
 
 		 751 aa  1542    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  81.46 
 
 		 746 aa  1266    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  50.2 
 
 		 724 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  49.32 
 
 		 746 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  82.43 
 
 		 750 aa  1272    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  55.21 
 
 		 742 aa  770    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  49.12 
 
 		 703 aa  673    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  81.59 
 
 		 746 aa  1266    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  49.37 
 
 		 746 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  68.98 
 
 		 759 aa  1071    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  63.11 
 
 		 746 aa  924    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  48.21 
 
 		 744 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  55.65 
 
 		 742 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  50.2 
 
 		 724 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  99.2 
 
 		 751 aa  1537    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  99.33 
 
 		 751 aa  1538    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  81.32 
 
 		 746 aa  1265    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  49.86 
 
 		 757 aa  681    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  81.46 
 
 		 746 aa  1268    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  81.32 
 
 		 746 aa  1266    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  99.47 
 
 		 751 aa  1540    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  48.77 
 
 		 740 aa  679    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  81.32 
 
 		 746 aa  1265    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  60.83 
 
 		 746 aa  924    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  48.48 
 
 		 744 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  47.66 
 
 		 744 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  47.36 
 
 		 749 aa  623  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  40.44 
 
 		 777 aa  474  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 665 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 681 aa  287  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  31.61 
 
 		 656 aa  273  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.31 
 
 		 650 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.31 
 
 		 650 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  31.64 
 
 		 663 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.18 
 
 		 650 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  31.64 
 
 		 663 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.64 
 
 		 663 aa  271  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 663 aa  271  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.18 
 
 		 650 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.64 
 
 		 663 aa  271  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.64 
 
 		 663 aa  271  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.59 
 
 		 659 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  31.64 
 
 		 641 aa  270  7e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.31 
 
 		 650 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 653 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.6 
 
 		 656 aa  225  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  29.44 
 
 		 665 aa  221  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  29.44 
 
 		 665 aa  221  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  29.44 
 
 		 665 aa  221  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 635 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  27.31 
 
 		 653 aa  216  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  27.98 
 
 		 655 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  26.97 
 
 		 652 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 648 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  29.6 
 
 		 665 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 657 aa  208  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 652 aa  207  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 658 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  26.63 
 
 		 663 aa  194  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 714 aa  192  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  26.44 
 
 		 666 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  26.41 
 
 		 666 aa  191  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  26.56 
 
 		 666 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  26.44 
 
 		 666 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  26.52 
 
 		 666 aa  190  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  26.12 
 
 		 663 aa  183  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.13 
 
 		 640 aa  183  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 702 aa  182  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  26.56 
 
 		 680 aa  181  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 740 aa  177  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  27.06 
 
 		 696 aa  173  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.77 
 
 		 696 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  27.19 
 
 		 695 aa  171  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  25.7 
 
 		 700 aa  170  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 698 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 649 aa  165  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 650 aa  164  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 649 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  26.48 
 
 		 702 aa  162  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 726 aa  160  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  24.48 
 
 		 656 aa  160  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 662 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 662 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 680 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 662 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 661 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  26.21 
 
 		 698 aa  154  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>