More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0763 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 783 aa  1575    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  49.02 
 
 		 817 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  40.46 
 
 		 717 aa  498  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  40.43 
 
 		 710 aa  481  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  40.2 
 
 		 704 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  38.27 
 
 		 721 aa  472  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  40.63 
 
 		 716 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  40.12 
 
 		 713 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  39.89 
 
 		 724 aa  445  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  36.58 
 
 		 771 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 		 849 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 697 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 701 aa  291  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 738 aa  289  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 700 aa  287  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  31.78 
 
 		 713 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 701 aa  280  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 721 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 704 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 723 aa  270  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 725 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 725 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 725 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 725 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 718 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 723 aa  257  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 723 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 723 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 809 aa  249  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  29.93 
 
 		 816 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  29.68 
 
 		 813 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 839 aa  228  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 739 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 728 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 843 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  28.05 
 
 		 812 aa  205  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 709 aa  205  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 716 aa  204  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 753 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  26.87 
 
 		 714 aa  187  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 758 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  27.34 
 
 		 755 aa  181  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 751 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 745 aa  167  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  25.47 
 
 		 723 aa  167  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 745 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 726 aa  164  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 745 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 746 aa  161  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  32.66 
 
 		 332 aa  160  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 698 aa  158  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 764 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 742 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 732 aa  148  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  24.57 
 
 		 732 aa  144  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  24.2 
 
 		 733 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  26.13 
 
 		 723 aa  141  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 808 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 817 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 808 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 747 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  34.85 
 
 		 833 aa  112  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 757 aa  105  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 809 aa  97.8  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 907 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 763 aa  91.3  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 810 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  29.8 
 
 		 808 aa  89.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 828 aa  88.6  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  32.26 
 
 		 848 aa  88.6  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 778 aa  88.2  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 769 aa  87.4  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 836 aa  87  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 791 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1011 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 987 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 845 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.48 
 
 		 681 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 753 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 782 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 988 aa  84  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  28.4 
 
 		 807 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.11 
 
 		 728 aa  83.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 924 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 812 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 893 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 1095 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 760 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 793 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 739 aa  82.4  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.09 
 
 		 695 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 748 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 861 aa  80.9  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  25.38 
 
 		 788 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1075 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 795 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1038 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 806 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>