More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0153 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 918 aa  1867    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 933 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  40.44 
 
 		 924 aa  595  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  40.5 
 
 		 803 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 812 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  38.66 
 
 		 797 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  38.92 
 
 		 797 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 812 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 812 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  38.92 
 
 		 797 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  38.91 
 
 		 817 aa  531  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  38.83 
 
 		 797 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  37.38 
 
 		 843 aa  505  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  39.14 
 
 		 797 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  38.05 
 
 		 853 aa  467  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 874 aa  465  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 924 aa  459  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  35.69 
 
 		 847 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 887 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 948 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  36.35 
 
 		 784 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  34.72 
 
 		 870 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 817 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 853 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  34.37 
 
 		 848 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 947 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 987 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 850 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 795 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 803 aa  409  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.99 
 
 		 811 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 793 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  34.54 
 
 		 795 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  34.04 
 
 		 788 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 		 795 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  34.74 
 
 		 793 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 811 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  33.87 
 
 		 840 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  33.21 
 
 		 961 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 788 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  32.11 
 
 		 948 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 800 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.17 
 
 		 800 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  32.23 
 
 		 823 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 871 aa  366  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 835 aa  366  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 868 aa  360  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 811 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 842 aa  348  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.68 
 
 		 867 aa  344  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.4 
 
 		 799 aa  341  4e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 815 aa  335  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 870 aa  334  4e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 861 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  30.77 
 
 		 821 aa  330  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  32.6 
 
 		 884 aa  328  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 867 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 851 aa  327  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 858 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 857 aa  326  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  30.93 
 
 		 864 aa  324  6e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 815 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 867 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 883 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 847 aa  320  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.61 
 
 		 832 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 800 aa  317  8e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 804 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 872 aa  316  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 833 aa  302  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 818 aa  301  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 849 aa  296  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 816 aa  291  5.0000000000000004e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 885 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 869 aa  280  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.44 
 
 		 856 aa  278  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 813 aa  266  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 858 aa  264  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 842 aa  260  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 873 aa  224  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 852 aa  209  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 879 aa  206  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.5 
 
 		 1015 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 877 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 843 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 836 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 841 aa  145  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.81 
 
 		 839 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  25.72 
 
 		 709 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 842 aa  138  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 817 aa  128  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 855 aa  124  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 855 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 757 aa  122  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 873 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  41.71 
 
 		 873 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  41.71 
 
 		 869 aa  118  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  44.97 
 
 		 884 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 843 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 904 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>