More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2531 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 843 aa  1675    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  44.51 
 
 		 856 aa  643    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2047  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 803 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 1020 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 981 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  37.38 
 
 		 1000 aa  174  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 883 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 869 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  24.82 
 
 		 827 aa  134  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 973 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 874 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  40.54 
 
 		 857 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 849 aa  129  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  38.86 
 
 		 869 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 875 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 847 aa  127  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 861 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 861 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 852 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 861 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  40.18 
 
 		 922 aa  125  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 861 aa  125  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 861 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  39.71 
 
 		 861 aa  124  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 		 871 aa  124  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 956 aa  123  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  24.66 
 
 		 839 aa  122  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.91 
 
 		 853 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 855 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 853 aa  120  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  25.86 
 
 		 709 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  42.93 
 
 		 969 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  41.97 
 
 		 901 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  37.37 
 
 		 974 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 908 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 891 aa  119  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  34.47 
 
 		 914 aa  119  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  44.38 
 
 		 925 aa  119  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 912 aa  118  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 843 aa  118  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  36.28 
 
 		 872 aa  118  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 841 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 		 890 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 		 890 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 		 890 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 838 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 818 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2859  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 902 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115194  normal  0.0892472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 813 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 918 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  41.12 
 
 		 874 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 836 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 873 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 800 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 873 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 907 aa  115  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 933 aa  114  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 896 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 909 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 869 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 937 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  39.38 
 
 		 897 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 816 aa  113  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 795 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  39.29 
 
 		 910 aa  112  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  40.46 
 
 		 846 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.66 
 
 		 800 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  39.13 
 
 		 884 aa  111  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 882 aa  111  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  37.69 
 
 		 817 aa  110  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 886 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 886 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  41.34 
 
 		 967 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  36.68 
 
 		 904 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  36.68 
 
 		 904 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 939 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 942 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 882 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 938 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  39.91 
 
 		 946 aa  110  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 909 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 976 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  42.24 
 
 		 867 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  39.13 
 
 		 883 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 981 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 883 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 883 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 966 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 		 879 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  36.32 
 
 		 896 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  39.39 
 
 		 866 aa  108  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 966 aa  108  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 876 aa  108  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 842 aa  108  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1132  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 930 aa  108  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  35.05 
 
 		 895 aa  107  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 892 aa  108  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 930 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 924 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4602  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 875 aa  108  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.683128  normal  0.437508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>