More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3152 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  75.77 
 
 		 811 aa  1215    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 811 aa  1641    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  55.87 
 
 		 795 aa  838    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  39.5 
 
 		 784 aa  514  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 795 aa  515  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  38.39 
 
 		 788 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  38.81 
 
 		 795 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 788 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  38.08 
 
 		 812 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  38.08 
 
 		 812 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  38.08 
 
 		 812 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 		 797 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 		 797 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  37.7 
 
 		 797 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  37.7 
 
 		 797 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 843 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  37.77 
 
 		 803 aa  475  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  37.91 
 
 		 817 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 793 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  36.2 
 
 		 793 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  37.63 
 
 		 811 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.85 
 
 		 800 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 800 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  38.45 
 
 		 803 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 853 aa  442  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.33 
 
 		 799 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  35.62 
 
 		 797 aa  426  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  37.68 
 
 		 842 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.52 
 
 		 832 aa  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  35.3 
 
 		 815 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  34.78 
 
 		 821 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 835 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 948 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 874 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  31.83 
 
 		 840 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 918 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  32.33 
 
 		 961 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 933 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  35.35 
 
 		 884 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 871 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 883 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  32.79 
 
 		 833 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 847 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 817 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 853 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 924 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 815 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 849 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  32.38 
 
 		 848 aa  369  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 887 aa  363  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.74 
 
 		 856 aa  363  7.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 800 aa  362  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  31.7 
 
 		 823 aa  360  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 842 aa  354  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 924 aa  354  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 804 aa  353  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.7 
 
 		 867 aa  349  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 857 aa  345  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 867 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 		 847 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 816 aa  342  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  30.88 
 
 		 864 aa  341  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 867 aa  340  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 818 aa  337  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 851 aa  337  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 861 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 858 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 987 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  30.6 
 
 		 870 aa  331  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 868 aa  331  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 947 aa  328  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 850 aa  327  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 885 aa  321  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 858 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 872 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 813 aa  294  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 873 aa  291  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 869 aa  273  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.6 
 
 		 948 aa  269  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 879 aa  263  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 852 aa  259  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.7 
 
 		 1015 aa  231  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 877 aa  195  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 870 aa  191  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 849 aa  150  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  27.06 
 
 		 827 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  24.88 
 
 		 895 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  42.08 
 
 		 953 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 897 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  39.59 
 
 		 871 aa  115  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 852 aa  114  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 861 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 842 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 861 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 		 883 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 		 883 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 861 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 		 883 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25.89 
 
 		 620 aa  111  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>