More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3540 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  92.22 
 
 		 797 aa  1508    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  87.69 
 
 		 817 aa  1454    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  92.1 
 
 		 797 aa  1505    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  92.47 
 
 		 797 aa  1508    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 812 aa  1653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  99.63 
 
 		 812 aa  1645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  88.17 
 
 		 803 aa  1459    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  71.27 
 
 		 797 aa  1183    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  92.22 
 
 		 797 aa  1506    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  99.51 
 
 		 812 aa  1646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  42.4 
 
 		 843 aa  618  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  42.42 
 
 		 853 aa  600  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 918 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  39.1 
 
 		 933 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 948 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  38.47 
 
 		 853 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.39 
 
 		 800 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  40.65 
 
 		 800 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  40.51 
 
 		 795 aa  495  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 		 795 aa  492  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  38.25 
 
 		 788 aa  487  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  39.08 
 
 		 803 aa  485  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  39.51 
 
 		 784 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  38.08 
 
 		 788 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  38.08 
 
 		 811 aa  484  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  37 
 
 		 870 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  35.82 
 
 		 848 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.62 
 
 		 811 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 847 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 817 aa  452  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 793 aa  445  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 874 aa  446  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 811 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  37.52 
 
 		 793 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 924 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  35.96 
 
 		 840 aa  439  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  36.21 
 
 		 961 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  36.76 
 
 		 924 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  36.12 
 
 		 884 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 795 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.41 
 
 		 799 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 868 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 851 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  35.32 
 
 		 867 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  34.31 
 
 		 821 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 887 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 842 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 857 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 870 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 883 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 815 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 858 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 835 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.95 
 
 		 1015 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 861 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  33.48 
 
 		 864 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 867 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.25 
 
 		 832 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  34.82 
 
 		 823 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 869 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 871 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 815 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 		 850 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 804 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.13 
 
 		 818 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 947 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 		 833 aa  354  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 987 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 800 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.5 
 
 		 847 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 872 aa  339  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 816 aa  333  6e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 849 aa  320  9e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 858 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 813 aa  310  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 885 aa  287  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 842 aa  277  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  33.98 
 
 		 948 aa  270  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 873 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 852 aa  251  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 877 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 867 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.55 
 
 		 856 aa  233  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 879 aa  224  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 817 aa  194  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 869 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 838 aa  163  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 904 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 867 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 867 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 867 aa  131  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 867 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 		 873 aa  126  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  41.09 
 
 		 935 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  41.09 
 
 		 935 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  41.09 
 
 		 935 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  43 
 
 		 869 aa  124  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 		 873 aa  124  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  41.63 
 
 		 883 aa  124  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  39.43 
 
 		 883 aa  124  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>