More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  44.73 
 
 		 816 aa  642    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  53.84 
 
 		 804 aa  790    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  51.17 
 
 		 847 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  49.14 
 
 		 818 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  64.48 
 
 		 884 aa  1101    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 883 aa  1776    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  44.7 
 
 		 813 aa  651    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  40.28 
 
 		 842 aa  592  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  39.62 
 
 		 885 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.38 
 
 		 800 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 815 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  38.92 
 
 		 821 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  40.16 
 
 		 800 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  38.59 
 
 		 811 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  36.66 
 
 		 843 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  39.05 
 
 		 784 aa  442  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 815 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 795 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 933 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  37.33 
 
 		 788 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 788 aa  403  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 817 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 797 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 793 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 812 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 812 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 797 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  36.2 
 
 		 793 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.48 
 
 		 832 aa  396  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 797 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 803 aa  395  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 812 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 797 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 835 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 853 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 795 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 803 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.87 
 
 		 799 aa  379  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 811 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 800 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  35.21 
 
 		 795 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 842 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.91 
 
 		 811 aa  361  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  32.28 
 
 		 961 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  33.84 
 
 		 840 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 858 aa  356  8.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  32.85 
 
 		 797 aa  355  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 847 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 871 aa  354  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.49 
 
 		 1015 aa  350  7e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 887 aa  350  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 857 aa  347  7e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 851 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  31.81 
 
 		 823 aa  340  7e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 874 aa  337  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 948 aa  333  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 850 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 833 aa  328  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 853 aa  325  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 868 aa  325  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 918 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.74 
 
 		 856 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  32 
 
 		 848 aa  321  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 852 aa  321  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 924 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 849 aa  320  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  29.73 
 
 		 870 aa  309  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 817 aa  306  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 987 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.41 
 
 		 867 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 873 aa  304  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 869 aa  303  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 924 aa  295  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  29.29 
 
 		 864 aa  294  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 947 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 872 aa  289  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 879 aa  277  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 867 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 861 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 867 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 858 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 877 aa  191  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  29.02 
 
 		 948 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 870 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 874 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 843 aa  157  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.49 
 
 		 853 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 853 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 973 aa  141  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 853 aa  140  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 838 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 841 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 869 aa  135  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 843 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 897 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  24.39 
 
 		 839 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 817 aa  127  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 856 aa  127  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>