More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1342 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  98.49 
 
 		 793 aa  1592    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  47.29 
 
 		 788 aa  711    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  65.58 
 
 		 795 aa  1033    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  100 
 
 		 793 aa  1618    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  50.45 
 
 		 795 aa  736    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  47.66 
 
 		 788 aa  716    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  59.24 
 
 		 784 aa  865    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  42.21 
 
 		 800 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  42.96 
 
 		 800 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.28 
 
 		 799 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  39.7 
 
 		 803 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.92 
 
 		 811 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 795 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  36.9 
 
 		 853 aa  485  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 843 aa  478  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 811 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  37.7 
 
 		 803 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 933 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 812 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 812 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  37.27 
 
 		 797 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  37.27 
 
 		 797 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  37.62 
 
 		 812 aa  439  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  37.15 
 
 		 797 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 817 aa  438  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 797 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 815 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  38.02 
 
 		 797 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  34.71 
 
 		 840 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  36.4 
 
 		 811 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 835 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  35.88 
 
 		 884 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  34.27 
 
 		 961 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 948 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  36.66 
 
 		 847 aa  399  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 883 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 853 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.39 
 
 		 832 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 918 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 815 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  35.04 
 
 		 823 aa  392  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  33.8 
 
 		 870 aa  389  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 847 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  34.67 
 
 		 821 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 800 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 818 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 842 aa  379  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 924 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 817 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 804 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 885 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 842 aa  364  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  33.14 
 
 		 848 aa  363  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 887 aa  363  7.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 874 aa  361  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.44 
 
 		 856 aa  360  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 868 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 861 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 858 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 857 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 833 aa  353  8e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.08 
 
 		 867 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 867 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 858 aa  347  4e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 851 aa  347  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 871 aa  346  8e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 867 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 877 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 816 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 869 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 872 aa  335  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 813 aa  333  9e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 870 aa  326  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 850 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 987 aa  321  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  29.07 
 
 		 864 aa  314  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 873 aa  313  7.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 849 aa  309  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 924 aa  301  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 947 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 852 aa  290  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 879 aa  257  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.15 
 
 		 1015 aa  238  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.97 
 
 		 948 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  25.61 
 
 		 834 aa  156  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 853 aa  152  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 869 aa  150  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 853 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 853 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 853 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26 
 
 		 853 aa  144  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  26.96 
 
 		 709 aa  144  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 838 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 904 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 904 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 873 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 904 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 904 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  23.94 
 
 		 936 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 817 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>