More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  52.96 
 
 		 804 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  52.34 
 
 		 847 aa  753    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  46.79 
 
 		 818 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  43.88 
 
 		 816 aa  645    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  100 
 
 		 884 aa  1783    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  64.48 
 
 		 883 aa  1122    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  42.8 
 
 		 813 aa  620  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  40.3 
 
 		 842 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  40.08 
 
 		 885 aa  546  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.06 
 
 		 800 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  38.58 
 
 		 800 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  38.82 
 
 		 821 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  39.95 
 
 		 815 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 		 843 aa  465  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  39.4 
 
 		 795 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  38.66 
 
 		 784 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  37.13 
 
 		 811 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 		 812 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 		 812 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 797 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 797 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 812 aa  428  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 797 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 797 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 803 aa  425  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 793 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  35.88 
 
 		 793 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 		 817 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.45 
 
 		 799 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  36.35 
 
 		 803 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  36.08 
 
 		 788 aa  396  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 853 aa  396  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 933 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 		 811 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 		 788 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  33.99 
 
 		 797 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.55 
 
 		 832 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  35.88 
 
 		 795 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 815 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.94 
 
 		 811 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 795 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  33.58 
 
 		 840 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 871 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 800 aa  362  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 835 aa  361  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 847 aa  360  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 858 aa  360  6e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  33.46 
 
 		 823 aa  360  9e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  32.06 
 
 		 961 aa  357  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 842 aa  357  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.87 
 
 		 856 aa  353  5.9999999999999994e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 874 aa  352  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 817 aa  350  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 851 aa  347  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 948 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 833 aa  346  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  34.39 
 
 		 848 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 918 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 853 aa  336  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 887 aa  336  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 857 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 924 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 872 aa  326  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  30.07 
 
 		 864 aa  324  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 849 aa  322  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 868 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 924 aa  317  8e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  30.62 
 
 		 870 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.99 
 
 		 867 aa  313  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 873 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 850 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 870 aa  300  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 947 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 852 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 987 aa  294  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 879 aa  244  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 858 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  37.57 
 
 		 1015 aa  207  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 867 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 861 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 867 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  27.4 
 
 		 948 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 869 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 877 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 843 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 873 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 841 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 973 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 853 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  31.02 
 
 		 880 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.12 
 
 		 853 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 853 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 853 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 817 aa  132  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 855 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 855 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 838 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 853 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 836 aa  126  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 893 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>